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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005393`

染色体: Chr01 坐标: 71208974-71214212 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005393`
名称	SmilChr01G005393
描述	pleckstrin homology domain-containing protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71208974 - 71214212 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005722`
GeneID	`131005722`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005722`
原始查询	`SmilChr01G005393`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pleckstrin homology domain-containing protein 1-like
产物	pleckstrin homology domain-containing protein 1-like
Arabidopsis	`AT5G05710` (AT5G05710) Pleckstrin homology (PH) domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830455] identity=78.3; qcov=0.993; evalue=2.24e-83; confidence=high
Rice	`Os01g0856800` (P0683F02.4-1) - identity=80.3; qcov=0.986; evalue=3.21e-81; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00169 (PH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005722

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788755.1`
2	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057788755.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057788755.1`
4	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057788755.1`
5	Cell projection	细胞突起	0.20000	`XP_057788755.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71209162`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:71209405`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B6,C84
`Chr1:71209447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B7,B77,C80,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788755.1

144 aa

144

PF00169 PH 29-125 aa

XP_057788756.1

144 aa

144

PF00169 PH 29-125 aa

XP_057788757.1

144 aa

144

PF00169 PH 29-125 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788755.1`	Pfam	`PF00169`	PH	Domain	29	125	3.8e-21	76.3	PH domain
`XP_057788756.1`	Pfam	`PF00169`	PH	Domain	29	125	3.8e-21	76.3	PH domain
`XP_057788757.1`	Pfam	`PF00169`	PH	Domain	29	125	3.8e-21	76.3	PH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932774.1
ACTAAAAAAACAAATCCTAAGAAACAAAAGCATTGAGCTTGTGCTGTGACAGCTCCCACTCTCCACTTTTCAATTCCCCTTGCTCCCATCTCGATCTCCCAATCTGCATCAATGGTGAGCCTCTGGCGAGCCGCGATGGGCGCCACCCAGGCCAACGCCGACGAATACGACGGCGTCGAGTTCTGGGGCGCGGCGGAGCGCGCCGGCTGGCTCACTAAGCAGGGCGAGTACATCAAGACCTGGCGCCGCCGTTGGTTCGT...

XM_057932772.1
ACTAAAAAAACAAATCCTAAGAAACAAAAGCATTGAGCTTGTGCTGTGACAGCTCCCACTCTCCACTTTTCAATTCCCCTTGCTCCCATCTCGATCTCCCAATCTGCATCAATGGTGAGCCTCTGGCGAGCCGCGATGGGCGCCACCCAGGCCAACGCCGACGAATACGACGGCGTCGAGTTCTGGGGCGCGGCGGAGCGCGCCGGCTGGCTCACTAAGCAGGGCGAGTACATCAAGACCTGGCGCCGCCGTTGGTTCGT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131005722
ATGGTGAGCCTCTGGCGAGCCGCGATGGGCGCCACCCAGGCCAACGCCGACGAATACGACGGCGTCGAGTTCTGGGGCGCGGCGGAGCGCGCCGGCTGGCTCACTAAGCAGGGCGAGTACATCAAGACCTGGCGCCGCCGTTGGTTCGTCCTCAAGCAGGGCAAGCTCTTCTGGTTCAAGGAATCCAACGTCACCCGCGCCTCCCGCCCGCGCGGCGTCATCCCCGTCTCCGATTGCCTCACCGTCAAGGGCGCCGAGGA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057788755.1
MVSLWRAAMGATQANADEYDGVEFWGAAERAGWLTKQGEYIKTWRRRWFVLKQGKLFWFKESNVTRASRPRGVIPVSDCLTVKGAEDVLNRQFAFELSTRNDTMYFIADTEKEKEDWINSIGRSIVQHSRSVTDDEILDYDSRK

XP_057788756.1
MVSLWRAAMGATQANADEYDGVEFWGAAERAGWLTKQGEYIKTWRRRWFVLKQGKLFWFKESNVTRASRPRGVIPVSDCLTVKGAEDVLNRQFAFELSTRNDTMYFIADTEKEKEDWINSIGRSIVQHSRSVTDDEILDYDSRK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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