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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005402`

染色体: Chr01 坐标: 71273745-71277413 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005402`
名称	SmilChr01G005402
描述	GDP-Man:Man(3)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,2-mannosyltransferase
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71273745 - 71277413 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005729`
GeneID	`131005729`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005729`
原始查询	`SmilChr01G005402`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GDP-Man:Man(3)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,2-mannosyltransferase
产物	GDP-Man:Man(3)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1%2C2-mannosyltransferase
Arabidopsis	`AT2G40190` (LEW3) UDP-Glycosyltransferase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818610] identity=72.1; qcov=0.972; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0583000` - identity=69.5; qcov=0.552; evalue=7.84e-130; confidence=medium
GO	GO:0004377 (GDP-Man:Man(3)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,2-mannosyltransferase activity); GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0006487 (protein N-linked glycosylation); GO:0006490 (GO:0006490)
KEGG	smil00510 (N-Glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00513 (Various types of N-glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00534 (Glycos_transf_1); PF13692 (Glyco_trans_1_4); PF15924 (ALG11_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005729

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057788767.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057788767.1`
3	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057788767.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788767.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788767.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71274046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:71274808`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C37,C56,C65
`Chr1:71275554`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr1:71275650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B22
`Chr1:71276029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr1:71276096`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B104
`Chr1:71276096`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B104
`Chr1:71276931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,C37,C56,C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788767.1

464 aa

232

464

ALG11_N

Glycos_transf_1

Glyco_trans_1_4

PF15924 ALG11_N 35-240 aa PF00534 Glycos_transf_1 266-438 aa PF13692 Glyco_trans_1_4 271-421 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788767.1`	Pfam	`PF15924`	ALG11_N	Family	35	240	1.2e-88	297.3	ALG11 mannosyltransferase N-terminus
`XP_057788767.1`	Pfam	`PF00534`	Glycos_transf_1	Domain	266	438	8.5e-25	88.0	Glycosyl transferases group 1
`XP_057788767.1`	Pfam	`PF13692`	Glyco_trans_1_4	Domain	271	421	1.1e-14	55.6	Glycosyl transferases group 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932784.1
ACTATTTAAGGACCGTTAATGAAAAATAACTGAAGTTATTGGTAAAAATTACATTAATTTAACGTTAAGCTTAAAAAACCTTATAATTTCCTATTCGGCTGAATTTCAACTCTCCTTCAATGGCTTCACTTCGCATCTTGACTTTGCCTCTCGCAACCCTAATTTTGGCGTTAGTCGTCAGAATATTCTTGGTCGTAGTTTATCACCGGCGAAAGCGGAGGAATTCCGTCGGCTTCTTTCATCCCTACACCAACGATGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005729
ATGGCTTCACTTCGCATCTTGACTTTGCCTCTCGCAACCCTAATTTTGGCGTTAGTCGTCAGAATATTCTTGGTCGTAGTTTATCACCGGCGAAAGCGGAGGAATTCCGTCGGCTTCTTTCATCCCTACACCAACGATGGCGGTGGAGGCGAGCGAGTGCTATGGTGCGCCGTCAAAGCCGTCCAAGAGGAGTCGCCGGCCCTCGATTGTGTCGTCTACACCGGCGATCATGACGCTTCGCCTGACTCTCTTGCCGCTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788767.1
MASLRILTLPLATLILALVVRIFLVVVYHRRKRRNSVGFFHPYTNDGGGGERVLWCAVKAVQEESPALDCVVYTGDHDASPDSLAARAIDRFGVKLIHPPKVVHLYKRKWVEETTYPRFTMIGQSLGSMYLSWEALCTFTPLYYFDTSGYAFTYPVAWMFGCKVICYTHYPTISLDMLSRVNARNSMYNNDALIAKSAFFSQCKVIYYKLFSLMYGIVGSHAHLAMVNSSWTQSHIQKLWGIPDRIKRVYPPCDTSGLQM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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