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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005406`

染色体: Chr01 坐标: 71311053-71312558 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005406`
名称	SmilChr01G005406
描述	ethylene-responsive transcription factor ABI4
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71311053 - 71312558 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005733`
GeneID	`131005733`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005733`
原始查询	`SmilChr01G005406`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ethylene-responsive transcription factor ABI4
产物	ethylene-responsive transcription factor ABI4
Arabidopsis	`AT2G40220` (ABI4) Integrase-type DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818614] identity=80; qcov=0.376; evalue=3.28e-37; confidence=low
Rice	`Os05g0351200` (OsERF#117) - identity=85.7; qcov=0.229; evalue=6.22e-28; confidence=weak
GO	GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006950 (response to stress); GO:0045893 (positive regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00847 (AP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005733

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788770.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788770.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788770.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788770.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057788770.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71311643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr1:71311649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B24,B41,C15,C17,C60
`Chr1:71311690`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,B44
`Chr1:71311798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr1:71311933`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B137
`Chr1:71311941`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr1:71311990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:71312035`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr1:71312077`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,C7
`Chr1:71312337`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B74,B97,C17,C54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788770.1

306 aa

153

306

AP2

PF00847 AP2 47-91 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788770.1`	Pfam	`PF00847`	AP2	Domain	47	91	2.2e-12	47.8	AP2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932787.1
GCGACGCCCTTTGCACAGAGGCATTCTCCTCAATTGGGTAAACACACAACGAGGCAACCAAACCCCTCTTTCTCCCTCCCTCTCTCCAAATTTCTTTAATTTTAATTTCCCACCTCTCCCCCCCACCACTCACCATGAGCGGTGCTGCAATTTCAGACCCTAATCATCACCCTCCCCAAGGCCCCCTCCCCAACAACACCCCCCCACTCTCCACCGACGCCGCCGCCACCAAGAAGCCCAAGGGCAAGGGCGGCCCCGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005733
ATGAGCGGTGCTGCAATTTCAGACCCTAATCATCACCCTCCCCAAGGCCCCCTCCCCAACAACACCCCCCCACTCTCCACCGACGCCGCCGCCACCAAGAAGCCCAAGGGCAAGGGCGGCCCCGACAACAGCAAGTTCCGCTACCGCGGCGTCCGCCAGCGCAGCTGGGGGAAGTGGGTGGCGGAGATCCGCGAGCCCAGGAAGCGCACCCGCCGCTGGCTCGGCACCTTCGCCACCGCCGAGGACGCCGCGCGCGCCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788770.1
MSGAAISDPNHHPPQGPLPNNTPPLSTDAAATKKPKGKGGPDNSKFRYRGVRQRSWGKWVAEIREPRKRTRRWLGTFATAEDAARAYDRAAVILYGSRAQLNLQPSSGGAANNGGGGSSSQSSSRSSSSSSSSTQTLRPLLPRPSGFGLTYSAAPPQMTNYVQYGLYPAVQYPNIVPQTQLPPQQAAIAPSLPQQQQPYGMADLRVSESDPNSIRANSDANSSYPNPNHDCQNLQHNQNQNTQSFGYDEISTLCSTEPAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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