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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005411`

染色体: Chr01 坐标: 71347964-71351252 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005411`
名称	SmilChr01G005411
描述	uncharacterized protein At5g43822-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71347964 - 71351252 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005738`
GeneID	`131005738`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005738`
原始查询	`SmilChr01G005411`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OSJNBa0057L21.18; symbol=OSJNBa0057L21.18; hit=Os10g0566900; species=rice; confidence=high
产物	OSJNBa0057L21.18; symbol=OSJNBa0057L21.18; hit=Os10g0566900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G43822` (AT5G43822) Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:7922354] identity=48.5; qcov=0.995; evalue=1.63e-63; confidence=high
Rice	`Os10g0566900` (OSJNBa0057L21.18) - identity=49.5; qcov=0.995; evalue=1.61e-63; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF15011 (CA109-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005738

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057788778.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057788778.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057788778.1`
4	Spindle	Spindle	0.40000	`XP_057788778.1`
5	Cytoskeleton	细胞骨架	0.20000	`XP_057788778.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71348383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A21,B36,C80,D11
`Chr1:71348406`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,A3,B61
`Chr1:71348891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr1:71348915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B124,C61
`Chr1:71348916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr1:71348952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B124,C61
`Chr1:71348954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,A3,B61
`Chr1:71350060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr1:71350726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788778.1

199 aa

100

199

CA109-like

PF15011 CA109-like 4-198 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788778.1`	Pfam	`PF15011`	CA109-like	Domain	4	198	4.7e-58	196.7	Ribosome biogenesis protein C1orf109-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932795.1
AATTATAAATCAAATCAAACAATGCAAATACTCAAAAAAAAAAAAATTAATATAACGAATTAATTTTTTGTTACCAGTACCACCGTCTCTACTCTCGGCGCCGCCGCCTAAAACGTGACAACAAATCTTTGTAATCGGCGGGGGCCGAGTTTGAGTTGGGAGAGAATGGAGCCAATAGTGAAAAAGTATCAGCGACAATTCCGGAAAATTAAGGACGAAATTAGCAGATGGGAAGAGCTCCAGTCTCTACTTATTTCCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005738
ATGGAGCCAATAGTGAAAAAGTATCAGCGACAATTCCGGAAAATTAAGGACGAAATTAGCAGATGGGAAGAGCTCCAGTCTCTACTTATTTCCCAATTCTCTAACGCATCTTCCATCATCCAGAGGTTGCAGGCGATCCAAGATTCGCGAAACTATGGAACTTTGAGCTGTGTTGAGGGCATAGAAGGTGTTTTGTTGGCGAAGCAAACGGAATCCCTTCAAATCATCTTCATCTCCCTCAACAACACTATGAAAGAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788778.1
MEPIVKKYQRQFRKIKDEISRWEELQSLLISQFSNASSIIQRLQAIQDSRNYGTLSCVEGIEGVLLAKQTESLQIIFISLNNTMKEFCGIVSSLEKDVRDSKQIVKVGCAQITAKQLKQRVGVKPTLADCIEGLRLLEEMYRSEYLLKLSLVSALPALALKPSASADLGALQQLLVDQPNIPREEVQYIYDIIFAEEIS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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