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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005413`

染色体: Chr01 坐标: 71362738-71364954 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005413`
名称	SmilChr01G005413
描述	GDSL esterase/lipase At2g40250
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71362738 - 71364954 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005740`
GeneID	`131005740`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005740`
原始查询	`SmilChr01G005413`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GDSL esterase/lipase At2g40250
产物	GDSL esterase/lipase At2g40250
Arabidopsis	`AT2G40250` (AT2G40250) SGNH hydrolase-type esterase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818617] identity=42.3; qcov=0.921; evalue=1.38e-93; confidence=medium
Rice	`Os01g0832100` (OsGELP27) - identity=43.3; qcov=0.918; evalue=1.38e-95; confidence=medium
GO	GO:0006629 (lipid metabolic process); GO:0016298 (lipase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00657 (Lipase_GDSL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005740

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057788780.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788780.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788780.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788780.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788780.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71362935`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B125
`Chr1:71362935`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B125
`Chr1:71362938`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,B36
`Chr1:71363020`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C44
`Chr1:71363206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr1:71363319`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C49
`Chr1:71363378`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr1:71364163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:71364602`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788780.1

367 aa

184

367

Lipase_GDSL

PF00657 Lipase_GDSL 32-353 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788780.1`	Pfam	`PF00657`	Lipase_GDSL	Family	32	353	9.3e-27	95.2	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932797.1
GTTTGCATCTGCAGCGTGAGTTAATACATACATTAGTAAGAAAATGGAGAAGAATTTGTATCTCTCACTACTCTTCCTTCTCTCCATCATAACGCTACCCACCGCAATCACCGCCGCATGCCAAAAGCCAACCGCCGTATACGCATTCGGCGACTCCGTCTTCGACGCCGGCAACAACAACAAGCTCGCCACCATCTGCCGTGCCAACCACGCGCCTTACGGCGTGGACTTCCCGGGCAGAAGCGCCACGGGCAGGTTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005740
ATGGAGAAGAATTTGTATCTCTCACTACTCTTCCTTCTCTCCATCATAACGCTACCCACCGCAATCACCGCCGCATGCCAAAAGCCAACCGCCGTATACGCATTCGGCGACTCCGTCTTCGACGCCGGCAACAACAACAAGCTCGCCACCATCTGCCGTGCCAACCACGCGCCTTACGGCGTGGACTTCCCGGGCAGAAGCGCCACGGGCAGGTTCAGCAACGGGAAGCTGCCCGGAGACATTCTGGCCGCCGATTTGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788780.1
MEKNLYLSLLFLLSIITLPTAITAACQKPTAVYAFGDSVFDAGNNNKLATICRANHAPYGVDFPGRSATGRFSNGKLPGDILAADLGIKDLLPAYADAAAEAEELLTGATFASSCSGLDDLTAAEVGVHSLDKQFRNFQMALRLMKEKLGLEKAAAAMENGLFLISAGSDDMMNNYYVLPTTRAKYSLPAYHDKLLKNLETFVKKLHMAGAKRLAVMGLPPLGCLPVDVTANFLPSPPSQNANASRDPLRRECKSNHNSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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