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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005419`

染色体: Chr01 坐标: 71396945-71399306 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005419`
名称	SmilChr01G005419
描述	uncharacterized protein C24H6.02c-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71396945 - 71399306 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005747`
GeneID	`131005747`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005747`
原始查询	`SmilChr01G005419`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0819700; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os02g0819700; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G54826` (ZR3) Zim17-type zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745966] identity=48.6; qcov=0.932; evalue=3.27e-51; confidence=high
Rice	`Os02g0819700` - identity=48.4; qcov=0.979; evalue=2.16e-52; confidence=high
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0006457 (protein folding); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0030150 (protein import into mitochondrial matrix); GO:0050821 (protein stabilization); GO:0051087 (protein-folding chaperone binding)
KEGG	-
Pfam	PF05180 (zf-DNL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005747

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057788786.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057788786.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788786.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788786.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788786.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71397499`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B60
`Chr1:71397499`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr1:71398753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr1:71398757`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr1:71398790`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr1:71398892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:71399039`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr1:71399046`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:71399122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788786.1

190 aa

190

zf-DNL

PF05180 zf-DNL 105-165 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788786.1`	Pfam	`PF05180`	zf-DNL	Domain	105	165	2.5e-24	85.7	DNL zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932803.1
AATAATAATACTAATATCTTTTTTTTTTTCTTGAGAGAATAATAATAATAGCATTTTTTTTCTTTTCAATATTGCCAAAGGATGAGGGGTTAGGCAGACTCAAAATAGTAAATAAATCATGAATCGAGACGACACTGTGGCCTATCACCTGTCTGTCCCTCTTCTCTGGCTTTGGATCAAATTGAAGAACGTTGTCTCTATTGAGAAATCCAAAGTGAACACAGACACAGTGAGGAGCTGATCGATTTCGACCACACCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005747
ATGGCGGCGCGGCGAATTCTCTCTCTCATGGCTGCAAAATATGCACAGAATCCACTCCCGAGAGATGTCTCTAGGAAGTTTCATCCTTCTCCAAACTCATTCTCTCGCAACTACGAGCAGTATACCAGAGGATTCCAGTCTCTCCCAGAAGCCAGTGTTCCGTCTGCGCAAAGTCCAACCGAAAACGGAAGTTGCAGCTCGAACAGTGACCAGAGCACGAGCAGGTGTGTCCCCAGTTCGACAAATGATCAGGCTGCTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788786.1
MAARRILSLMAAKYAQNPLPRDVSRKFHPSPNSFSRNYEQYTRGFQSLPEASVPSAQSPTENGSCSSNSDQSTSRCVPSSTNDQAAVKHQVKSNLKVSERHDLVMMFTCKVCDTRNLKTACRESYDKGVVVARCNGCDNLHLIADRLGWFGEPSSVEEFLAARGEEVKKGSAETMNLTLEDLAGRTDVSI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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