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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005424`

染色体: Chr01 坐标: 71419189-71424192 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005424`
名称	SmilChr01G005424
描述	amino acid transporter AVT1C-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71419189 - 71424192 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005751`
GeneID	`131005751`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005751`
原始查询	`SmilChr01G005424`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	amino acid transporter AVT1C-like
产物	amino acid transporter AVT1C-like
Arabidopsis	`AT2G39130` (AT2G39130) Transmembrane amino acid transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818499] identity=67.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0101000` (OsATL11) - identity=63.5; qcov=0.9; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	smil04082 (Neuroactive ligand signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01490 (Aa_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005751

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057788794.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057788794.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788794.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788794.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788794.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71419828`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	52	A1,A11,A22,A23,A7,B104,B106,B108,B11,B115,B118,B120,B122,B13,B135,B137,B140,B21,B22,B28,B29,B36,B48,B5,B58,B68,B81,B85,B90,B92,B99,C10,C18,C2,C23,C28,C33,C38,C4,C44,C51,C55,C67,C7,C73,C76,C78,C79,C84,D4,D5,D7
`Chr1:71419842`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	16	A22,A23,B111,B15,B29,B3,B30,B31,B45,B50,B62,B89,C72,C76,C79,D9
`Chr1:71419915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:71420112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr1:71420962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C87
`Chr1:71421064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B75,C14,C20
`Chr1:71421136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B104,B2
`Chr1:71421683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr1:71421836`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:71421866`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:71422099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B139,C61,D10
`Chr1:71422178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B139,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788794.1

560 aa

280

560

Aa_trans

PF01490 Aa_trans 167-505 aa

XP_057788795.1

558 aa

279

558

Aa_trans

PF01490 Aa_trans 167-546 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788794.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	167	505	1e-63	216.1	Transmembrane amino acid transporter protein
`XP_057788795.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	167	546	6.4e-69	233.3	Transmembrane amino acid transporter protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932812.1
TGCCATGATTGGCTCAAATTGTTAAATCTTGTCGTTACACTTGACGGCCTCTGGATCGAAAAACACACAAGAAAATCATTGGACACAGTATATATGCACAGTTATGTATGTATATATGTGTGCATATGTATCTATATATATCTCAAAGCTACTGTTTTTCAACTACTGCAAACAGAGGAATGTTTGCTGTTTTATCTGTTCACCGAGAGAGACAGTGTCATGTGCCTATGAGTGTGTGTGTGTGTGAGGTCAGGAGGTGA...

XM_057932811.1
TGCCATGATTGGCTCAAATTGTTAAATCTTGTCGTTACACTTGACGGCCTCTGGATCGAAAAACACACAAGAAAATCATTGGACACAGTATATATGCACAGTTATGTATGTATATATGTGTGCATATGTATCTATATATATCTCAAAGCTACTGTTTTTCAACTACTGCAAACAGAGGAATGTTTGCTGTTTTATCTGTTCACCGAGAGAGACAGTGTCATGTGCCTATGAGTGTGTGTGTGTGTGAGGTCAGGAGGTGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005751
ATGAAGAACTCGGTGTCGGAGCAGAGCTTCTACATAGAGAGTGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGTGTCTGGAAAAGTTGATGATGATGATGATGATGAAGCTGGAAATGGTTCTGATTCGTCGAATTACTGCAGTGACAACGATAACGATAATGCGAGTGGGGAGCAAAGCAAGCCCAATTCCCTCAATCCCTCTTGGCCTCAAAGTTACAGGCAATCCATTGATCTATACAGTAGCGTCCCATCTCCGAGTCTCAACTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057788794.1
MKNSVSEQSFYIESEEEEEEEVSGKVDDDDDDEAGNGSDSSNYCSDNDNDNASGEQSKPNSLNPSWPQSYRQSIDLYSSVPSPSLNFLGTPTLSRLSSSFLSSSLTRRNTPEILPTLSKPLIPEAEKPKERRSSHSLLPPIPRKPSLKKLTPDGKPAVSHELPISRHSSFGQAVLNGMNVLCGVGILSTPYAVREGGWLGLSILLIFAVLSYYTGILLRFCLDSTPGLETYPDIGQAAFGTIGRVAISIVLYVELYACCV...

XP_057788795.1
MKNSVSEQSFYIESEEEEEEEVSGKVDDDDDDEAGNGSDSSNYCSDNDNDNASGEQSKPNSLNPSWPQSYRQSIDLYSSVPSPSLNFLGTPTLSRLSSSFLSSSLTRRNTPEILPTLSKPLIPEAEKPKERRSSHSLLPPIPRKPSLKKLTPDGKPAVSHELPISRHSSFGQAVLNGMNVLCGVGILSTPYAVREGGWLGLSILLIFAVLSYYTGILLRFCLDSTPGLETYPDIGQAAFGTIGRVAISIVLYVELYACCV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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