当前解析结果
SmilChr01G005425| 统一新 Gene ID | SmilChr01G005425 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G005425 |
| 描述 | probable protein S-acyltransferase 15 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 71431908 - 71436387 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131005753 |
|---|---|
| GeneID | 131005753 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131005753 |
| 原始查询 | SmilChr01G005425 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | probable protein S-acyltransferase 15 |
| 产物 | probable protein S-acyltransferase 15 |
| Arabidopsis | AT5G04270 (AT5G04270)DHHC-type zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830306] identity=58.2; qcov=1; evalue=1.9e-108; confidence=high |
| Rice | Os01g0844400 (P0446B05.1-1)- identity=49.6; qcov=0.989; evalue=1.99e-87; confidence=high |
| GO | GO:0016409 (palmitoyltransferase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF01529 (DHHC) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131005753 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.80000 | XP_057788796.1 |
| 2 | Vacuole membrane | 液泡膜 | 0.40000 | XP_057788796.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057788796.1 |
| 4 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.20000 | XP_057788796.1 |
| 5 | Trans-golgi network | Trans-golgi network | 0.20000 | XP_057788796.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:71433572 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C4 |
Chr1:71433620 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B46,B68 |
Chr1:71433775 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B41,C17 |
Chr1:71435888 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B51 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057788796.1PF01529
DHHC 96-215 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057788796.1 |
Pfam | PF01529 |
DHHC | Family | 96 | 215 | 1.3e-36 | 126.3 | DHHC palmitoyltransferase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。