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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005433`

染色体: Chr01 坐标: 71479049-71484760 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005433`
名称	SmilChr01G005433
描述	eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71479049 - 71484760 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005762`
GeneID	`131005762`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005762`
原始查询	`SmilChr01G005433`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A-like
产物	eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A-like
Arabidopsis	`AT4G11420` (EIF3A) eukaryotic translation initiation factor 3A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826746] identity=67.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0120800` (eIF-3a) - identity=67.3; qcov=0.985; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0001732 (formation of cytoplasmic translation initiation complex); GO:0002188 (translation reinitiation); GO:0003729 (mRNA binding); GO:0003743 (translation initiation factor activity); GO:0043614 (multi-eIF complex); GO:0071540 (eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3e); GO:0071541 (eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3m)
KEGG	-
Pfam	PF01399 (PCI); PF22591 (eIF3a_PCI_TPR-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005762

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057788809.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057788809.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057788809.1`
4	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057788809.1`
5	Midbody	Midbody	0.20000	`XP_057788809.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71480151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr1:71480616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr1:71481263`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B125,C44
`Chr1:71481278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B11
`Chr1:71481726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:71481897`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B13,B46,C3,C49
`Chr1:71482484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr1:71483442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B36,B5,C33
`Chr1:71483690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B36,B5,C33
`Chr1:71483705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,C39
`Chr1:71484209`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B11,B46,C80
`Chr1:71484211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788809.1

962 aa

481

962

eIF3a_PCI_TPR-like

PCI

PF22591 eIF3a_PCI_TPR-like 8-408 aa PF01399 PCI 437-508 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788809.1`	Pfam	`PF22591`	eIF3a_PCI_TPR-like	Repeat	8	408	8.7e-135	450.4	eIF3a, PCI domain, TPR-like region
`XP_057788809.1`	Pfam	`PF01399`	PCI	Domain	437	508	3.2e-06	28.0	PCI domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932826.1
AATTTGGTTAGGGATTCTGATATAAGACTGTGCTGTGCGATTGTAGGCGTCTCTAACTGTATCTCAGTGCTCCGCCGTCGCACCGCCATCGACACCGCCGTAGTGACTCATCACTGTAACAACAGTTTAATTGCCTTCCGATATGGCTACTTTTGCCAGACCTGAGAATGCTTTAAAGCGAGCCGAAGAGTTGATCAATGTTGATCAAAAGCAAGAAGCACTTGAGGCTCTTCATAGTTTTATTACCTCAAGGAGGTATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005762
ATGGCTACTTTTGCCAGACCTGAGAATGCTTTAAAGCGAGCCGAAGAGTTGATCAATGTTGATCAAAAGCAAGAAGCACTTGAGGCTCTTCATAGTTTTATTACCTCAAGGAGGTATAGAGCCTGGACAAGAACACATGAAAAAATAATGTTCAAGTATGTGGAGCTATGTGTAGACATGAGGAGGGGAAGACATGCCAAGGATGGCCTTATCCAATACCGTGGTATCTGCCAACAGGTCAACATTAGTTCATTGGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788809.1
MATFARPENALKRAEELINVDQKQEALEALHSFITSRRYRAWTRTHEKIMFKYVELCVDMRRGRHAKDGLIQYRGICQQVNISSLEEVIKHFMQLATEKAELARNQAQVLEEALDVDDLEADKRPEDLLLSYVSGEKGKDRSDRELVTPWFKFLWETYRSVLEILRNNSRLEALYAMTAHRAFQFCKQYKRTTEFRRLCEIIRNHLANLNKYRDQRDRPDLTIPESLQLYLDTRFEQLKVATELELWQEAFRSIEDIYGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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