当前解析结果
SmilChr01G005448| 统一新 Gene ID | SmilChr01G005448 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G005448 |
| 描述 | protein METHYLENE BLUE SENSITIVITY 1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 71552051 - 71552827 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131005786 |
|---|---|
| GeneID | 131005786 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131005786 |
| 原始查询 | SmilChr01G005448 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein METHYLENE BLUE SENSITIVITY 1-like |
| 产物 | protein METHYLENE BLUE SENSITIVITY 1-like |
| Arabidopsis | AT3G02790 (AT3G02790)zinc finger (C2H2 type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820985] identity=69.5; qcov=1.01; evalue=3.47e-48; confidence=medium |
| Rice | Os06g0708600- identity=73.7; qcov=1.1; evalue=2.74e-52; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131005786 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057788853.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057788853.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057788853.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057788853.1 |
| 5 | Nucleolus | 核仁 | 0.20000 | XP_057788853.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:71552336 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B119,B73,C19,C3 |
Chr1:71552393 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C1,C35,C71 |
Chr1:71552534 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B83,C1,C35,C71 |
Chr1:71552644 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 58 | A11,A23,A5,A7,B104,B105,B108,B117,B118,B125,B127,B131,B133,B18,B21,B24,B26,B28,B29,B32,B35,B41,B42,B43,B48,B52,B58,B59,B62,B64,B80,B85,B94,C15,C17,C18,C20,C22,C23,C25,C28,C38,C40,C44,C50,C52,C53,C59,C60,C61,C70,C73,C78,C79,C82,D4,D5,D6 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。