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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005460`

染色体: Chr01 坐标: 71615057-71617227 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005460`
名称	SmilChr01G005460
描述	uncharacterized SmilChr01G005460
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71615057 - 71617227 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005791`
GeneID	`131005791`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005791`
原始查询	`SmilChr01G005460`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transmembrane protein, putative (Protein of unknown function, DUF538) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819935]; symbol=AT3G07470; hit=AT3G07470; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	transmembrane protein, putative (Protein of unknown function, DUF538) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819935]; symbol=AT3G07470; hit=AT3G07470; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G07470` (AT3G07470) transmembrane protein, putative (Protein of unknown function, DUF538) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819935] identity=49; qcov=0.761; evalue=1.4e-40; confidence=medium
Rice	`Os01g0913100` - identity=50.9; qcov=0.617; evalue=3.57e-35; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04398 (DUF538)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005791

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057788856.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057788856.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057788856.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057788856.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788856.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71615301`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B37
`Chr1:71615301`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B37
`Chr1:71616751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B97,C62
`Chr1:71616769`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B126
`Chr1:71616769`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B126
`Chr1:71616809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr1:71616852`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr1:71616856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B3,B69,C21
`Chr1:71616859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B93
`Chr1:71616871`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B120,B123,B136,C41
`Chr1:71616882`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B52,B57,B58
`Chr1:71616883`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788856.1

188 aa

188

DUF538

PF04398 DUF538 37-145 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788856.1`	Pfam	`PF04398`	DUF538	Family	37	145	1.1e-27	97.5	Protein of unknown function, DUF538

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932873.1
AGGAAAACACAATGAGCTGCATATTGCGTTCAACAAGAACAGGAGGCCAGACACAAACGTATTTATAAGGAGAGAGAGAGAGAGAAATAATTGCATTTTCTAAACCCCAATTTCCAATCTCAATTTCAATTTCAATTTCCTGCAACAATGGTGTTGCGCAATCCAATGACAACGGCGATGCTCCTCATCGCCGCAATAACCCTAGCTATGGCGGAAGAAACTCCGCACCCCAAATCGGTGCAGCTGGTGACGTTTTACGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005791
ATGGTGTTGCGCAATCCAATGACAACGGCGATGCTCCTCATCGCCGCAATAACCCTAGCTATGGCGGAAGAAACTCCGCACCCCAAATCGGTGCAGCTGGTGACGTTTTACGACATCCTCCGCTCCCACGGCCTCCCCATCGGCATATTCCCCAAAAGCATCTCCGGTTTCTCCGTCGACCCTGCATCCGGCGGCTTCCGCCTCCGCTTGCCGTCTCCTTCGCCGTGCGACACCGTGTTCGAGACCCGCCTCCGGTATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788856.1
MVLRNPMTTAMLLIAAITLAMAEETPHPKSVQLVTFYDILRSHGLPIGIFPKSISGFSVDPASGGFRLRLPSPSPCDTVFETRLRYECDITGRIRYGRISNLTGVLAQELFLWLPVRGIQVDIPSSGLIYFDVEVVSKQFSLSLFDTLKDCSSAEDVDGYGDLLKVPQVPSENIMRTHSTDQENRAAS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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