当前解析结果
SmilChr01G005468| 统一新 Gene ID | SmilChr01G005468 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G005468 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G005468 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 71667769 - 71670845 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131005799 |
|---|---|
| GeneID | 131005799 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131005799 |
| 原始查询 | SmilChr01G005468 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0005515 (protein binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131005799 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057788868.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057788868.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057788868.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057788868.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057788868.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:71667975 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B80,C72 |
Chr1:71668021 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr1:71668045 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B111,B3,C76 |
Chr1:71668061 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B111,B3,C76 |
Chr1:71668067 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B111,B3,C76 |
Chr1:71668161 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C8 |
Chr1:71668586 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C9 |
Chr1:71668973 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr1:71669440 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C5 |
Chr1:71669668 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B2 |
Chr1:71670103 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 17 | A25,B115,B12,B129,B130,B132,B20,B36,B55,B72,B74,B76,B86,C28,C32,C68,C86 |
Chr1:71670156 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 32 | A25,B114,B115,B129,B130,B132,B137,B140,B15,B20,B32,B36,B38,B46,B55,B59,B63,B72,B76,B86,B98,C22,C28,C32,C51,C61,C63,C65,C67,C68,C71,C86 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。