当前解析结果
SmilChr01G005470| 统一新 Gene ID | SmilChr01G005470 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G005470 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G005470 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 71686096 - 71689393 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131005801 |
|---|---|
| GeneID | 131005801 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131005801 |
| 原始查询 | SmilChr01G005470 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131005801 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057788870.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057788870.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057788870.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057788870.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057788870.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:71686307 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C8 |
Chr1:71686397 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A22,B132,B94,C10,C66 |
Chr1:71686435 |
ACC |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 11 | A15,A20,B104,B134,B18,B37,B72,B98,C12,C54,D3 |
Chr1:71686442 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr1:71686473 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A25,B27,B63,D7 |
Chr1:71686488 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B68,B78,C26,C8 |
Chr1:71686506 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A15,C11,C69 |
Chr1:71686536 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | D10 |
Chr1:71686536 |
AC |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr1:71686642 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C63 |
Chr1:71686670 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B78,C26,C61,C8,D5 |
Chr1:71686711 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。