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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005481`

染色体: Chr01 坐标: 71780374-71786159 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005481`
名称	SmilChr01G005481
描述	putative ABC1 protein At2g40090
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71780374 - 71786159 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005814`
GeneID	`131005814`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005814`
原始查询	`SmilChr01G005481`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative ABC1 protein At2g40090
产物	putative ABC1 protein At2g40090
Arabidopsis	`AT2G40090` (ATH9) ABC2 homolog 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818597] identity=71.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0698350` - identity=68; qcov=0.748; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005743 (mitochondrial inner membrane); GO:0007005 (mitochondrion organization); GO:0055088 (lipid homeostasis)
KEGG	-
Pfam	PF03109 (ABC1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005814

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057788888.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057788888.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057788888.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788888.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788888.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71780729`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr1:71781791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B64,C74
`Chr1:71781845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,C27,C3
`Chr1:71781858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr1:71782322`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B44
`Chr1:71782339`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B47,C80,D2
`Chr1:71782339`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B47,C80,D2
`Chr1:71782357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C76
`Chr1:71782372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B5,B71,C87
`Chr1:71782768`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:71782831`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B41
`Chr1:71782873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B41,C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788888.1

539 aa

270

539

ABC1

PF03109 ABC1 130-388 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788888.1`	Pfam	`PF03109`	ABC1	Domain	130	388	4.2e-82	275.7	ABC1 atypical kinase-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932905.1
GATTTTTAACCACTATTTGCGAAAACTTCTACATGTCCCACTTACCAAGAACAATAAATTCTTAATTTGGAGTTTAAATTCAAATAAAAACTTAAAACATAGGGCAAATTATTATTTAATTAATTAAAGCATCGAAATTGCCGAGCTATAGCCTATAGAGAATTAAACGTCGAAGCCAAGCAACGCTATTTCTTGTCGGCATTAGCGAGGAAGAAGGAAAATCGCACAGAAGAGAGGAAATGGCGGTTAGAGCTTTTTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005814
ATGGCGGTTAGAGCTTTTTTGCGCGCCAAAACTAAATTACTTTTGGTGGCTACTGCAGCGGCCGGCGCCGGCGCTGGCGCCGTCTCCATTGCCAACTCCGATGATCCGGCTTCAGCTCTCAAACTCGCCACCACCGTTCCCCTCCGCCTTCTCCGCGACGCTGCCACCGCCGCCACCATCGTGTATGATTACGAATACTCACTCTTGGGGTTGCCTGATGGCAGCAAAGAAAGGGAAAGAGTTAAACGCGAAGTTCATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788888.1
MAVRAFLRAKTKLLLVATAAAGAGAGAVSIANSDDPASALKLATTVPLRLLRDAATAATIVYDYEYSLLGLPDGSKERERVKREVHSRSAHKLQELCFRNGGIYIKLGQHISQLEYLVPDEYVQVMRQSMLNKCPVSSYEQVLQVFKKELGGAPDEIFDEFDPVPIASASLAQVHIARTHDGQQVAVKVQHIHMTDTAQADYATVELLVNVLHRVFPSFDYRWLVDEMRESLPKELDFLIEAKNSIKCMDNFRRFSPHIA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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