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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005482`

染色体: Chr01 坐标: 71787762-71790309 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005482`
名称	SmilChr01G005482
描述	NAC domain-containing protein 2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71787762 - 71790309 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005815`
GeneID	`131005815`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005815`
原始查询	`SmilChr01G005482`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NAC domain-containing protein 2-like
产物	NAC domain-containing protein 2-like
Arabidopsis	`AT5G14000` (NAC084) NAC domain containing protein 84 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831248] identity=31.9; qcov=0.828; evalue=1.12e-17; confidence=low
Rice	`Os03g0815100` (SNAC1) - identity=32.7; qcov=1.03; evalue=1.71e-19; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0048731 (system development)
KEGG	-
Pfam	PF02365 (NAM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005815

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788890.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788890.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788890.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788890.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057788890.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71787815`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,B84
`Chr1:71787865`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:71787872`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C34
`Chr1:71787901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C82,D6
`Chr1:71787914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C6,C61,D6
`Chr1:71787942`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B5,B71,C87
`Chr1:71787966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,B82
`Chr1:71789277`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A8,B50,B67,C30,C43,C6,C70
`Chr1:71789311`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B44,C60
`Chr1:71789328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B44,C60,D11
`Chr1:71789329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,B84
`Chr1:71789330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,B84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788890.1

163 aa

163

NAM

PF02365 NAM 11-134 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788890.1`	Pfam	`PF02365`	NAM	Family	11	134	1.9e-25	90.4	No apical meristem (NAM) protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932907.1
GCCTCTCATTCCTTCTTCTTACTCGAGTTTTCACCTCGAAAACTCATAATAATGGATCCCATCAAATCCTCGTTGAATTTGCCGTTCGGGTACAAGTTCGATCCGACAAGCGTGGAGTTATTACAACATTATCTGATTCCGAAATTGAGAGGCGAAAAGCTCCCGTCCGATTACGTTATGGATCTCGACCATCTCTACACCTACGAGCCCTGTCAACTCCCCTTCAATCAATTCAAGCATGCAAAAAACGATGAGGCATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005815
ATGGATCCCATCAAATCCTCGTTGAATTTGCCGTTCGGGTACAAGTTCGATCCGACAAGCGTGGAGTTATTACAACATTATCTGATTCCGAAATTGAGAGGCGAAAAGCTCCCGTCCGATTACGTTATGGATCTCGACCATCTCTACACCTACGAGCCCTGTCAACTCCCCTTCAATCAATTCAAGCATGCAAAAAACGATGAGGCATTCTTCTTCACAACGGATATAAGGAAAAGTTCCGAGGAAGAGAGTCAAATTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788890.1
MDPIKSSLNLPFGYKFDPTSVELLQHYLIPKLRGEKLPSDYVMDLDHLYTYEPCQLPFNQFKHAKNDEAFFFTTDIRKSSEEESQIRTTSNGYWKVYKDHVAVDIAGEVIGFKTKLFFYGVNRNRTYWKMIEYRCHPTRIPIDIVERYIICKIKLKKVEEEEG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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