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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005487`

染色体: Chr01 坐标: 71817116-71820099 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005487`
名称	SmilChr01G005487
描述	protein PHOTOSYSTEM I ASSEMBLY 2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71817116 - 71820099 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005821`
GeneID	`131005821`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005821`
原始查询	`SmilChr01G005487`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PHOTOSYSTEM I ASSEMBLY 2, chloroplastic
产物	protein PHOTOSYSTEM I ASSEMBLY 2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G34860` (EDA3) DnaJ/Hsp40 cysteine-rich domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818051] identity=58.3; qcov=1; evalue=7.64e-65; confidence=high
Rice	`Os08g0463900` (PSA2) - identity=71; qcov=0.686; evalue=1.93e-62; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF30758 (Orange_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005821

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057788897.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.80000	`XP_057788897.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057788897.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057788897.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788897.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71817860`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:71817864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D11,D7
`Chr1:71817866`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D10
`Chr1:71817889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B68,D7
`Chr1:71818987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr1:71819043`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,C78
`Chr1:71819056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,A5,B61,C18
`Chr1:71819069`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,C26,C30,C85
`Chr1:71819079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr1:71819151`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:71819927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788897.1

191 aa

191

Orange_C

PF30758 Orange_C 107-163 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788897.1`	Pfam	`PF30758`	Orange_C	Domain	107	163	7e-08	33.5	ORANGE protein C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932914.1
AAAAAAGATAAAAATAAAATAAAATAAAAAAATCCACCACCACTCGAACAAAACTCATCTCTTTTACAAAACTTGCACTCTCACACACACTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGCTTCTCATCTCTCTTCACATTCACCCTCAGCTATATCAAGCTTCTCTCTGCAACATGCTAAGCCTCGCTCGAACCGCTATGCTAATTTCAAGCCAGTTGGATTGCAAGTTAGATCCAGTTTGGAGGATGAGACCGGCGCTTCTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005821
ATGGCTTCTCATCTCTCTTCACATTCACCCTCAGCTATATCAAGCTTCTCTCTGCAACATGCTAAGCCTCGCTCGAACCGCTATGCTAATTTCAAGCCAGTTGGATTGCAAGTTAGATCCAGTTTGGAGGATGAGACCGGCGCTTCTTCTAGTTCCGATAGCTCGTTAGAGCTTACGAGGACAGAGGCATCTCATACTGCAACCTCTCGTCGTCAGTGTCTGACTTGTATATGCTCAACTATGGCACTGATAGTTGCTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788897.1
MASHLSSHSPSAISSFSLQHAKPRSNRYANFKPVGLQVRSSLEDETGASSSSDSSLELTRTEASHTATSRRQCLTCICSTMALIVAPGISDSDSKAVAMDDKEKAVCRNCRGSGAIICDMCGGTGKWKALNRKRAKDVYEFTECPNCYGRGILVCPVCLGTGLPNNKGLLRRPDARQLLDKMYNGRLLPNS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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