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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005490`

染色体: Chr01 坐标: 71830982-71831763 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005490`
名称	SmilChr01G005490
描述	pleckstrin homology domain-containing protein 1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71830982 - 71831763 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005825`
GeneID	`131005825`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005825`
原始查询	`SmilChr01G005490`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pleckstrin homology domain-containing protein 1
产物	pleckstrin homology domain-containing protein 1
Arabidopsis	`AT5G05710` (AT5G05710) Pleckstrin homology (PH) domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830455] identity=78.3; qcov=0.973; evalue=8.34e-84; confidence=high
Rice	`Os01g0856800` (P0683F02.4-1) - identity=81.8; qcov=0.973; evalue=1.85e-82; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00169 (PH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005825

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788904.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057788904.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057788904.1`
4	Cell junction	细胞连接	0.40000	`XP_057788904.1`
5	Cell projection	细胞突起	0.40000	`XP_057788904.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71831138`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,C77,D1
`Chr1:71831160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,C45
`Chr1:71831211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B80,D11
`Chr1:71831220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr1:71831250`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr1:71831322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B140
`Chr1:71831358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr1:71831425`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B133,B136,B98,C44
`Chr1:71831502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr1:71831537`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788904.1

147 aa

147

PF00169 PH 29-125 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788904.1`	Pfam	`PF00169`	PH	Domain	29	125	1.6e-20	74.3	PH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932921.1
AAAAGTAGTGTGATAAATGAAGAATAAAAATAGTAGTCCCATGAAATTAATAGACGGAAGCAGACAAAAACTAGAAAAGTTGCTCTCGCTCTCATCAATCCCCAAAATCACCGTCCATGGCGAGCCTGTGGCGAGCTGCGATGGGCTCGGCTCAAGCCGGAGCAGATGACTACGACGGCGTTGAGTTCTGGGGCACGCCGGAGCGCGCCGGCTGGCTGATGAAGCAGGGCGAGTACATCAAGACCTGGCGCCGCCGCTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005825
ATGGCGAGCCTGTGGCGAGCTGCGATGGGCTCGGCTCAAGCCGGAGCAGATGACTACGACGGCGTTGAGTTCTGGGGCACGCCGGAGCGCGCCGGCTGGCTGATGAAGCAGGGCGAGTACATCAAGACCTGGCGCCGCCGCTGGTTCGTGCTGAAGCAGGGGAAGCTCTTCTGGTTCAAGGAATCCACCGTCACCCGCGCCTCCAGGCCTCGCGGCGTCATCCCGGTCGCCAATTGCCTCACCGTCAAGGGCGCCGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788904.1
MASLWRAAMGSAQAGADDYDGVEFWGTPERAGWLMKQGEYIKTWRRRWFVLKQGKLFWFKESTVTRASRPRGVIPVANCLTVKGAEDVLNRQFAFELSTRTETMYFIADAEKEKEDWINSIGRSIVQHSRSVTDNEVLDYDSRKGLG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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