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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005491`

染色体: Chr01 坐标: 71833093-71833920 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005491`
名称	SmilChr01G005491
描述	30S ribosomal protein S31, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71833093 - 71833920 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005826`
GeneID	`131005826`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005826`
原始查询	`SmilChr01G005491`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	30S ribosomal protein S31, chloroplastic
产物	30S ribosomal protein S31%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G38140` (PSRP4) plastid-specific ribosomal protein 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818392] identity=54.4; qcov=1.08; evalue=2.04e-26; confidence=medium
Rice	`Os05g0186000` (OJ1111_A10.15) - identity=47.2; qcov=1.08; evalue=3.27e-32; confidence=medium
GO	GO:0005840 (ribosome); GO:0009536 (plastid); GO:0032544 (plastid translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF17067 (RPS31)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005826

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057788905.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057788905.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788905.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788905.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788905.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71833514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B136,B49,B61,D9
`Chr1:71833556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B74,C83
`Chr1:71833661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr1:71833663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B35,B94,C20
`Chr1:71833687`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788905.1

116 aa

116

RPS31

PF17067 RPS31 1-97 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788905.1`	Pfam	`PF17067`	RPS31	Family	1	97	3.4e-28	98.4	Ribosomal protein S31e

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932922.1
AGATATACCAACATTCCCATCAAAACGGCGTCGTTCGATCTCCACATTTTATCCGAAACACAATCCTTTTGTCCACCAATTCACAATTTCGTTGCTCAATTCCCACAGATTTTGAGAATTGAGATGGCGTCTCTCTTGCTCGGAGTTGGAGCTCCTCCCATGGCTTCCAGACCCCTCACAATTCCCCCTTCTCTTTCTCTCTCTAAGTCTCAAACCCTATTCAATGCCCCTTCCTCCCTCTCCACCTCCATATCCGCCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005826
ATGGCGTCTCTCTTGCTCGGAGTTGGAGCTCCTCCCATGGCTTCCAGACCCCTCACAATTCCCCCTTCTCTTTCTCTCTCTAAGTCTCAAACCCTATTCAATGCCCCTTCCTCCCTCTCCACCTCCATATCCGCCCCTACGCTTCCTCTCATTTTCTGCGGCCGAGGGGACAAGAAAACTGCTAGGGGAAAGCGCTTCAATCACTCATTCGGCAATGCGAGGCCCAAGGATAAGAAGAAGGGGAGAGGGCCGCCGAGGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788905.1
MASLLLGVGAPPMASRPLTIPPSLSLSKSQTLFNAPSSLSTSISAPTLPLIFCGRGDKKTARGKRFNHSFGNARPKDKKKGRGPPRVPAPPLPPRKDKYDDGEVVKIEIDESLFGN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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