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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005493`

染色体: Chr01 坐标: 71850644-71852817 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005493`
名称	SmilChr01G005493
描述	probable inactive histone-lysine N-methyltransferase SUVR1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71850644 - 71852817 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005827`
GeneID	`131005827`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005827`
原始查询	`SmilChr01G005493`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable inactive histone-lysine N-methyltransferase SUVR1
产物	probable inactive histone-lysine N-methyltransferase SUVR1
Arabidopsis	`AT2G40020` (AT2G40020) Nucleolar histone methyltransferase-related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818590] identity=48.5; qcov=0.288; evalue=3.1e-11; confidence=weak
Rice	`Os09g0114700` - identity=43.9; qcov=0.28; evalue=1.86e-10; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10440 (WIYLD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005827

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788906.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788906.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788906.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788906.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057788906.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71850851`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,C23,D7
`Chr1:71850867`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B90,B92
`Chr1:71850869`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B33,C71
`Chr1:71850957`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr1:71850974`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A2,B110,B38,B39,C12,C23,C71,C78
`Chr1:71850989`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A2,B110,B38,B39,C12,C23,C71,C78
`Chr1:71850991`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A2,B110,B38,B39,C12,C23,C71,C78
`Chr1:71851010`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A2,B110,B38,B39,C12,C23,C71,C78
`Chr1:71851014`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A2,B110,B38,B39,C12,C23,C71,C78
`Chr1:71851625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C30,C33
`Chr1:71851693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr1:71851819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788906.1

236 aa

118

236

WIYLD

PF10440 WIYLD 9-68 aa

XP_057788907.1

236 aa

118

236

WIYLD

PF10440 WIYLD 9-68 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788906.1`	Pfam	`PF10440`	WIYLD	Domain	9	68	2.2e-23	82.5	Ubiquitin-binding WIYLD domain
`XP_057788907.1`	Pfam	`PF10440`	WIYLD	Domain	9	68	2.2e-23	82.5	Ubiquitin-binding WIYLD domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932923.1
ATTGTTACTTTAAAAATCCCATCTCATTTTTATTTGGCAAAAATGATAAAAATATGATTGGCCATTGGGAGAGATCATGCACTCATTGCTTCACCAAAACCCTAAACCCAACGTTGATCTTATTTGCATCATCTTTTTCCGCTTGTTTCTACACAACACAAGCATGAATCTGTCTCCCTATCTCCCCCTTCAATACTCGTCTCGGAAATCGTTCACGAAAACCAAAATTTTTGAAAAACTTGATTGATCAGTGACAGATG...

XM_057932924.1
TATGATTGGCCATTGGGAGAGATCATGCACTCATTGCTTCACCAAAACCCTAAACCCAACGTTGATCTTATTTGCATCATCTTTTTCCGCTTGTTTCTACACAACACAAGCATGAATCTGTCTCCCTATCTCCCCCTTCAATACTCGTCTCGGAAATCGTTCACGAAAACCAAAATTTTTGAAAAACTTGATTGATCAGTGACAGATGCGACTTTGTGCTCGATTTTGAAGTGGGAAAAATGGCTCCGAGGAGGCGACGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005827
ATGGCTCCGAGGAGGCGACGCTCGAAGGTAGGTTTGGGGAGAATGGACGCTGCGCTAGACGCCATGCGCCCCATGGGTTTCCCCGCCGACGCTGTGCGCAAATCCGTGAAGAAACTTCTTAAGGTTTATGGTGATGGTGGGTGGCCATTCATAGAGGAGGCTGCATATAAGTTGCTCATTGACACAATTCTTGAGGAGCCGGAGGGGGATCAGCTAGGGCATGAGACGGGACTTTCGCCACCGGAAAGTTGTTCAAAAGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057788906.1
MAPRRRRSKVGLGRMDAALDAMRPMGFPADAVRKSVKKLLKVYGDGGWPFIEEAAYKLLIDTILEEPEGDQLGHETGLSPPESCSKGSLEQPASGNELSDKAATYDEHEEPLPPVQSCSKGSLKQPASGKELCDEVATYDELVELPIYCQEVKLEGENIEGRDSGFEDVEEHEEMGVGVDLGPAYVPQPVSRVPTGGQRRPCYGWISDEDEDDEMVELAPSTSSLQMLLHEEKLSR

XP_057788907.1
MAPRRRRSKVGLGRMDAALDAMRPMGFPADAVRKSVKKLLKVYGDGGWPFIEEAAYKLLIDTILEEPEGDQLGHETGLSPPESCSKGSLEQPASGNELSDKAATYDEHEEPLPPVQSCSKGSLKQPASGKELCDEVATYDELVELPIYCQEVKLEGENIEGRDSGFEDVEEHEEMGVGVDLGPAYVPQPVSRVPTGGQRRPCYGWISDEDEDDEMVELAPSTSSLQMLLHEEKLSR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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