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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005496`

染色体: Chr01 坐标: 71865043-71868647 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005496`
名称	SmilChr01G005496
描述	uncharacterized SmilChr01G005496
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71865043 - 71868647 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005831`
GeneID	`131005831`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005831`
原始查询	`SmilChr01G005496`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837239]; symbol=AT1G07280; hit=AT1G07280; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837239]; symbol=AT1G07280; hit=AT1G07280; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G07280` (AT1G07280) Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837239] identity=42.7; qcov=0.78; evalue=2.01e-96; confidence=medium
Rice	`Os05g0447700` - identity=39.5; qcov=0.788; evalue=4.36e-79; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005831

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057788910.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057788910.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788910.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788910.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788910.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71866035`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr1:71866200`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	15	A24,A6,B10,B104,B11,B139,B32,B41,B74,B95,C24,C81,C83,D5,D6
`Chr1:71866273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B50,D10
`Chr1:71866300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr1:71866352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr1:71866375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr1:71866573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B22,B6,C37,C84
`Chr1:71866657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr1:71866664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr1:71866828`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C41,C48,C49
`Chr1:71866913`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	64	A16,A22,A5,B1,B104,B105,B107,B11,B111,B117,B118,B125,B136,B138,B139,B20,B3,B30,B32,B36,B40,B42,B43,B46,B50,B54,B55,B57,B63,B65,B66,B68,B77,B78,B93,B94,B99,C1,C11,C18,C2,C23,C25,C26,C29,C31,C33,C34,C35,C44,C47,C5,C51,C58,C69,C71,C76,C77,C78,C9,D1,D11,D7,D8
`Chr1:71866917`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	63	A16,A22,A5,B1,B104,B107,B11,B111,B117,B118,B125,B136,B138,B139,B20,B3,B30,B32,B36,B40,B42,B43,B46,B50,B54,B55,B57,B63,B65,B66,B68,B77,B78,B93,B94,B99,C1,C11,C18,C2,C23,C25,C26,C29,C31,C33,C34,C35,C44,C47,C5,C51,C58,C69,C71,C76,C77,C78,C9,D1,D11,D7,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932927.1
GCCATTGATGAAGCTGCCCCACAACTGGTCCTAAAAGCGCAACGCTTGTTTTTGGTGCTTACTAAATATCGTCTTCTCATATCTTCCTATCCTTCTATCCCTCATCCGATTCTTCCCTTCATCTCCCCCTTTTTTCCATTTTTTTCTTTTCTCGCAATTTTTTTTTCTTTTTATATATCTCCACGATAATCTTCCTACTCATTTCCACTCAAACTTCCACGGCTCATCACAGTTTATCCGAATTCCGTGGTGATTCATTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005831
ATGAGGCTCAAACCTGTTTCGCCCACTGCAGATTGCTCACACCATGCCTCCTTCCAACCCTTCTTCACCTCATCATCCTTCCGCTTTCGAACCTCTGAAATGGATGGGCCTCTATCCCTTGTCTTCTCCCCCAAAACTCTCCTTAAAACGCGGTCTTTTAGCAAGGTCTCCAAGGGTAACAACATTATTAGGCGCTCTTGCAGCTTGAATTTGGATGAGAAGCCCTCCTTCCACGTGGAGGCGTCGGCCAAGATGATGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788910.1
MRLKPVSPTADCSHHASFQPFFTSSSFRFRTSEMDGPLSLVFSPKTLLKTRSFSKVSKGNNIIRRSCSLNLDEKPSFHVEASAKMMSNGPREEEGRKKQHCAISNGNTPFFGRQGGRRDQKDSFLESRFDFLEPMMLGIKPEFPDWPDKDTAAWTVIEHKANSLDIPLSLRMIKKKLQLEEGFAGGSMEGSEAEGGGYCSVKAAFASMVFIIVELQSCALHMREALCDEDLDVITSKVQKEMHLSFVWLFQQVFSRTPAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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