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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005497`

染色体: Chr01 坐标: 71870273-71874029 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005497`
名称	SmilChr01G005497
描述	glycosylinositol phosphorylceramide mannosyl transferase 1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71870273 - 71874029 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005832`
GeneID	`131005832`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005832`
原始查询	`SmilChr01G005497`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycosylinositol phosphorylceramide mannosyl transferase 1
产物	glycosylinositol phosphorylceramide mannosyl transferase 1
Arabidopsis	`AT3G55830` (EPC1) Nucleotide-diphospho-sugar transferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824749] identity=68.8; qcov=0.963; evalue=5.69e-161; confidence=high
Rice	`Os06g0705000` - identity=62.6; qcov=0.788; evalue=7.02e-120; confidence=high
GO	GO:0006486 (GO:0006486); GO:0016020 (membrane); GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF09258 (Glyco_transf_64)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005832

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057788911.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057788911.1`
3	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057788911.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788911.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788911.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71870519`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C40,C50
`Chr1:71870553`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B88,C10
`Chr1:71870577`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B7
`Chr1:71870577`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B7
`Chr1:71871209`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr1:71871235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B86,B9,C55
`Chr1:71871236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:71871241`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr1:71871247`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B86,B9,C55
`Chr1:71871249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B3,B86,B9,C55
`Chr1:71871250`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B58,C20,D8
`Chr1:71871980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B137

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788911.1

326 aa

163

326

Glyco_transf_64

PF09258 Glyco_transf_64 66-319 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788911.1`	Pfam	`PF09258`	Glyco_transf_64	Domain	66	319	7e-78	262.0	Glycosyl transferase family 64 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932928.1
AAGGTGTAAAAATTAGTTACTCCATCTTAGATATTTTTATCCCAAAAAAAAAAAAAAACGAGAAGAATAACTAACTTTTATTTGCTTGATTTATCGAGGGCTCGAGTCCTATATTCCCGTTTGAAAAATTTTCTCAGTTGTGAATCTAAACTGACGAAATCGAGGGCGAGGCATGACGTCATCACCGACGTGAACTGATCTCCGGCAACCGCCTGCTCAGCCACCACCCGTCGTTGTATGGAATCGCCGCAGCCTGCGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005832
ATGAGGACGAGCCTTTTCAGCCGCCGGACGATAAGGCAGGGAGCGATGTCCGCCGTCGGATCGGCGAAGATGAAGCTAATGTTTGGCTGCTGCGTGCTGTTGACACTGATCGCGCTCGCTAGCCGCACGACGTCGTATGGAGGGTGGAAGCAATACGCTGTTTATCCGCGCGGATCATCTCTGCCTCGGAAAGGGTACACCTTATTGATTAACACATGGAAAAGAAATGATCTTCTGAAGCAATCCATATCCCATTATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788911.1
MRTSLFSRRTIRQGAMSAVGSAKMKLMFGCCVLLTLIALASRTTSYGGWKQYAVYPRGSSLPRKGYTLLINTWKRNDLLKQSISHYASCPGLDSIHIVWSEPNPPSESLINFLNHVIKLNSKDGWKVELRFDINKEDSLNNRFKEIKDLKSDVVFSIDDDIIFPCATVEFAFSVWQSAPDTMVGFVPRIHWVDKSKNGQDAFIYSGWWSVWWTGTYSMILSKAAFFHKKYLSTYTYEMPSSIREYVTKNRNCEDIAMSFL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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