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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005500`

染色体: Chr01 坐标: 71888810-71889944 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005500`
名称	SmilChr01G005500
描述	uncharacterized SmilChr01G005500
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71888810 - 71889944 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005835`
GeneID	`131005835`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005835`
原始查询	`SmilChr01G005500`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Fasciclin-like arabinogalactan family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824748]; symbol=AT3G55820; hit=AT3G55820; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Fasciclin-like arabinogalactan family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824748]; symbol=AT3G55820; hit=AT3G55820; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G55820` (AT3G55820) Fasciclin-like arabinogalactan family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824748] identity=37.6; qcov=1.02; evalue=3.95e-37; confidence=medium
Rice	`Os03g0237950` - identity=54.4; qcov=0.238; evalue=8.15e-07; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02469 (Fasciclin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005835

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057788916.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057788916.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057788916.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057788916.1`
5	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057788916.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71889142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B105,B69,C6
`Chr1:71889161`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B138,C35
`Chr1:71889161`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B138,C35
`Chr1:71889163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:71889206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr1:71889244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B67,C58,D5,D8
`Chr1:71889364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr1:71889426`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr1:71889461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:71889465`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:71889505`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:71889555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788916.1

193 aa

193

Fasciclin

PF02469 Fasciclin 70-174 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788916.1`	Pfam	`PF02469`	Fasciclin	Domain	70	174	1.1e-06	29.6	Fasciclin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932933.1
GTGGACGGAGGGAATAATTCATTCAGGTCTTGCCATCTAAACAGAACCTATAACAACAAAAAAGCCAAAAAAAAAAAACAAAGAAAAACAAAGTACTAATTGATTAAAATATCCCCAATAAGAAAAAGCAGTGGATCTTGACAATGAGCACGGACTCGGTTGCTAACTCATCAAGCATCCGAGTTAACCCAGGCATCTCTATCTAATTATTCCAATCTTTTCTTAAATCTATCACAGTTTCTCTACATCCATTTGCAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005835
ATGAGAAGAAGAAAAATCGGGAATTTGAAGCTGAAGAGCCCAGTGAAACTGGTGTGCACGATCGTCACCGTTTCATTCATAATCACACAGATCTTCACTGCGGTTAAGCTCAGAGGCATACCTCGATCGGCAATTGCTTCAACCAAAACAGAATCCCCCGCCAAACGCGCGAGAATCGGCGAGTTCGGGGAAACGGTGATTAAGTTGTTACCTGAGGATCTGGCGTTCACGCTCTTCCTGCCGTCGGAGGAGGCGATTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788916.1
MRRRKIGNLKLKSPVKLVCTIVTVSFIITQIFTAVKLRGIPRSAIASTKTESPAKRARIGEFGETVIKLLPEDLAFTLFLPSEEAIRRDLRLNRNDSDAYAVLTRVLGFSSVPRWIWTADLERGGRRSYDSISGLSLSVGKDSNGNVVVNGVVSEVVDLRIGKTVVHVMDGVVMDAEFEQSVRPESDDDDEFD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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