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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005504`

染色体: Chr01 坐标: 71903118-71905093 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005504`
名称	SmilChr01G005504
描述	uncharacterized SmilChr01G005504
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71903118 - 71905093 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005840`
GeneID	`131005840`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005840`
原始查询	`SmilChr01G005504`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0590366; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0590366; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0590366` - identity=26.3; qcov=1.02; evalue=3.16e-21; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12776 (Myb_DNA-bind_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005840

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788922.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788922.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788922.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788922.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057788922.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71903366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B138,B18,C32
`Chr1:71903369`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr1:71903763`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr1:71903791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr1:71903804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C29,C44,C70
`Chr1:71903836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr1:71903950`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B114,B140,B35
`Chr1:71903975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr1:71904086`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B79
`Chr1:71904086`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B79
`Chr1:71904087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr1:71904099`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788922.1

318 aa

159

318

Myb_DNA-bind_3

PF12776 Myb_DNA-bind_3 31-126 aa

XP_057788923.1

314 aa

157

314

Myb_DNA-bind_3

PF12776 Myb_DNA-bind_3 27-122 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788922.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	31	126	5.5e-06	28.0	Myb/SANT-like DNA-binding domain
`XP_057788923.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	27	122	5.3e-06	28.0	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932940.1
GGTTAGGTTTAGTCAATGTTGCTAAAAATAGGATTAATTTGCAGGTTAGAGGCATTGATATGATGCTGGTCATATATGTTTGATATGCAACGTTAATTATCGAAATACCAACTCGGCTGATTGGTAGCCTCCATTACAACCAACACTATAATTTGAATGCCCTATTTTGCCCTTAAATTCCATTTGTAAAATACTGAAATACCCTCACATCTCACTAGGTCATTATAGCGGCAAAATTCGCCCCATTTTTCTTTGTTAAA...

XM_057932939.1
GGTTAGGTTTAGTCAATGTTGCTAAAAATAGGATTAATTTGCAGGTTAGAGGCATTGATATGATGCTGGTCATATATGTTTGATATGCAACGTTAATTATCGAAATACCAACTCGGCTGATTGGTAGCCTCCATTACAACCAACACTATAATTTGAATGCCCTATTTTGCCCTTAAATTCCATTTGTAAAATACTGAAATACCCTCACATCTCACTAGGTCATTATAGCGGCAAAATTCGCCCCATTTTTCTTTGTTAAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005840
ATGGCAAGCAATGCGGGGCAACAAGGGAGCACCGAAGGTTGCCGAGGCAGGGTAAGTAAGACGGACAAGACCCGTCGTAGCTGGTCGAAAAGGGAAGAGGAGATATTGCTGGCATCGTTGAAGGAAATCGTTGCTCAAGGCTGGAAGGCAGACAATGGCTTTAGGGGCGGCTATCTGACCAAGCTTGAGGAGTCAATCCGTAAGGAATTTCCAGATAGTGACATCAAAGGCATGCCCCACATTAACTCAAAGATCAGTTC...

LOC131005840
ATGGCAAGCAATGCGGGGCAACAAGATATGCAAGCAGGGAGCACCGAAGGTTGCCGAGGCAGGGTAAGTAAGACGGACAAGACCCGTCGTAGCTGGTCGAAAAGGGAAGAGGAGATATTGCTGGCATCGTTGAAGGAAATCGTTGCTCAAGGCTGGAAGGCAGACAATGGCTTTAGGGGCGGCTATCTGACCAAGCTTGAGGAGTCAATCCGTAAGGAATTTCCAGATAGTGACATCAAAGGCATGCCCCACATTAACTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057788922.1
MASNAGQQDMQAGSTEGCRGRVSKTDKTRRSWSKREEEILLASLKEIVAQGWKADNGFRGGYLTKLEESIRKEFPDSDIKGMPHINSKISSWKKSYNSLLGMLDVSGVGFNHKGTFMIDCDNDQWELIVKKDKNALNMRFKSWPMLDDWKEIFGKDRANGVQAEDLMEAVHDMYTAENIAQEDRGAYFNSADEEVPTDEAEVSVCQTEKKCNKGGGSKKKRKSPDEFDRLCDVLGEIGRDTGLRLGDLVTRIGYEFDLGQ...

XP_057788923.1
MASNAGQQGSTEGCRGRVSKTDKTRRSWSKREEEILLASLKEIVAQGWKADNGFRGGYLTKLEESIRKEFPDSDIKGMPHINSKISSWKKSYNSLLGMLDVSGVGFNHKGTFMIDCDNDQWELIVKKDKNALNMRFKSWPMLDDWKEIFGKDRANGVQAEDLMEAVHDMYTAENIAQEDRGAYFNSADEEVPTDEAEVSVCQTEKKCNKGGGSKKKRKSPDEFDRLCDVLGEIGRDTGLRLGDLVTRIGYEFDLGQARQT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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