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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005505`

染色体: Chr01 坐标: 71906613-71908474 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005505`
名称	SmilChr01G005505
描述	uncharacterized acetyltransferase At3g50280-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71906613 - 71908474 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005841`
GeneID	`131005841`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005841`
原始查询	`SmilChr01G005505`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818586]; symbol=AT2G39980; hit=AT2G39980; species=arabidopsis; confidence=high
产物	HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818586]; symbol=AT2G39980; hit=AT2G39980; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G39980` (AT2G39980) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818586] identity=66.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0854000` - identity=55.5; qcov=0.996; evalue=1.51e-164; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005841

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788924.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057788924.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788924.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788924.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788924.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71906819`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A13,A2,A3,B101,B105,B111,B122,B126,B127,B129,B139,B16,B49,B68,B79,B93,B94,C11,C16,C41,C42,C57,C69
`Chr1:71906933`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr1:71906993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,C74
`Chr1:71907065`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr1:71907116`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr1:71907381`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:71907395`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	36	A7,B10,B103,B106,B113,B114,B119,B126,B138,B25,B38,B39,B41,B44,B49,B62,B73,B74,B77,B89,B98,C13,C19,C2,C24,C29,C32,C34,C43,C67,C68,C73,C83,C84,D4,D6
`Chr1:71907398`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	36	A7,B10,B103,B106,B113,B114,B119,B126,B138,B25,B38,B39,B41,B44,B49,B62,B73,B74,B77,B89,B98,C13,C19,C2,C24,C29,C32,C34,C43,C67,C68,C73,C83,C84,D4,D6
`Chr1:71907449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C2
`Chr1:71907454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C2
`Chr1:71907482`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr1:71907509`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	20	A19,B100,B105,B107,B11,B120,B122,B123,B139,B14,B15,B17,B54,B61,B68,B9,B91,C27,C76,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788924.1

481 aa

240

481

Transferase

PF02458 Transferase 12-473 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788924.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	12	473	4.5e-106	355.8	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932941.1
AAATTAAAAATTGATAAAAATATAAAAACAGCATCACCCCCAATAACCAACACTGCCACCGCAGCAGCAAATGCATGAACCCAGCCACCCCCTTCGGCCCCTATATATACCGCCCCCCGCCCCCCTTTCTCCCTCACTCTCTCTCACTCGCTTCTCACTGCCACCTCCTTCCCCTTTCAGTAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAGAGAAGATGGTTTCGCAGTCGTCGAATCTTCCATTAGTCTCTCGCTGCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005841
ATGGTTTCGCAGTCGTCGAATCTTCCATTAGTCTCTCGCTGCACCGTCTTCCCCGACCGGGAATCCACCGTTCCCGATCTCAAGCTCTCCGTCTCCGATCTCCCCATGCTCTCCTGCCACTACATTCAGAAAGGCTGCTTGTTCACGCGGCCGCCGCTCCCGGCGGCGGAGCTCGTCTCGCAGCTGAAGACCGCCCTCTCGCAGGCGCTCTCGCAATTCCCGCCCCTCGCCGGCCGCCTCGCCACCGACGCGGAGGGGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788924.1
MVSQSSNLPLVSRCTVFPDRESTVPDLKLSVSDLPMLSCHYIQKGCLFTRPPLPAAELVSQLKTALSQALSQFPPLAGRLATDAEGYVYIACNDAGADFSHVYGGGIRVRDLLGSADGDVPAEFKGFFPCDLTVSYEGHFRPILAVRVTELADGVFIGCAVNHAVTDGTSFWNFFNSFAELSRGVRKVSRAPDFSRESLLISAAVLRLPEGGPKVTFDSGAPVRERIFRFSRESIQKLKAAVNNRKLEGGIDIAELMGKH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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