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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005509`

染色体: Chr01 坐标: 71948435-71949956 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005509`
名称	SmilChr01G005509
描述	uncharacterized SmilChr01G005509
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71948435 - 71949956 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005845`
GeneID	`131005845`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005845`
原始查询	`SmilChr01G005509`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=45.3; qcov=0.652; evalue=7.31e-34; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=52.1; qcov=0.964; evalue=1.9e-83; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005845

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788929.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057788929.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788929.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788929.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057788929.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71948568`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,D10
`Chr1:71948591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B22,B59,C20
`Chr1:71948598`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr1:71948609`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B4
`Chr1:71948610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:71948613`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B51,C40,C63
`Chr1:71948620`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B124
`Chr1:71948623`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	26	A13,A20,B103,B125,B130,B27,B46,B48,B64,B82,B84,B87,B9,C20,C23,C30,C42,C53,C54,C63,C74,C76,C84,C86,D1,D2
`Chr1:71948631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr1:71948640`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A22,A5,B108,B120,B137,B29,B33,B69,B93,C23,C26,C29,C57,C68,C70,C74
`Chr1:71948641`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C3
`Chr1:71948643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,B74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788929.1

247 aa

124

247

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 70-108 aa PF04827 Plant_tran 177-247 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788929.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	70	108	2.1e-19	69.7	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057788929.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	177	247	8.5e-30	104.6	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932946.1
CTACGAAGAACAATTCTCTCATATCCAATACATATCTTCATATTCTCAAAACACACGACTTATGTCTTCATCTTCTTCTGAACATGATGTTGAAGAAACGGCTGCATCTGCAGCTGCAGCTGTAGCTGTAGCTGAAGCTGAAGCCTTTATGGAAGAGTACATGCGCCAATACATGGAGGATAATAGTATCCATCAACATGTGCTGCGAGCAATAGCGTCAAACACACCTCACACGAGACGATATGTGCAACGAGATCGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005845
ATGTCTTCATCTTCTTCTGAACATGATGTTGAAGAAACGGCTGCATCTGCAGCTGCAGCTGTAGCTGTAGCTGAAGCTGAAGCCTTTATGGAAGAGTACATGCGCCAATACATGGAGGATAATAGTATCCATCAACATGTGCTGCGAGCAATAGCGTCAAACACACCTCACACGAGACGATATGTGCAACGAGATCGGGAAGGAGCACACGAGCGACTCATGCGGGATTATTTTGATGATAATCCAACATGGGGTCCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788929.1
MSSSSSEHDVEETAASAAAAVAVAEAEAFMEEYMRQYMEDNSIHQHVLRAIASNTPHTRRYVQRDREGAHERLMRDYFDDNPTWGPNVFRRRFRMRKELFTRIVNALEAHNTWFQQRPDATGKKGFTPLQKCTNAIRQLAYGGPADHYDEYLRISETTGYECLRHFCRGVIEVFGGHYLRRPTVDDYQRLMEMHEQRHGFPGMLGSLDCMHWTWKNCPVAWKGQFTRGDHGVPTIMLEAVASQNLWI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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