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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005518`

染色体: Chr01 坐标: 71992706-71995479 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005518`
名称	SmilChr01G005518
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71992706 - 71995479 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005855`
GeneID	`131005855`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005855`
原始查询	`SmilChr01G005518`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK3
产物	G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK3
Arabidopsis	`AT5G24080` (AT5G24080) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832473] identity=32.9; qcov=1.07; evalue=1.39e-116; confidence=low
Rice	`Os03g0828800` - identity=40.2; qcov=0.995; evalue=2.58e-173; confidence=medium
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF01453 (B_lectin); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005855

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057788940.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788940.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788940.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788940.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788940.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71992721`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	A8,B100,B108,B110,B130,B15,B74,C27,C35,D10
`Chr1:71992738`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	75	A1,A10,A14,A16,A18,A2,A20,A22,A24,A3,B100,B101,B104,B11,B114,B124,B126,B128,B132,B16,B17,B19,B23,B33,B4,B40,B43,B45,B47,B48,B49,B53,B55,B56,B61,B63,B66,B7,B73,B77,B78,B79,B80,B83,B84,B91,B95,C1,C10,C11,C15,C19,C30,C36,C45,C46,C48,C5,C51,C58,C6,C61,C62,C64,C68,C69,C71,C78,C80,C85,D2,D6,D7,D8,D9
`Chr1:71992843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C30
`Chr1:71992895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B25,C29,C40
`Chr1:71992898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B106,B14,B84,C13,C28,C38
`Chr1:71992928`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B51,B61,C31
`Chr1:71992960`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr1:71992999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B25,B32,C29
`Chr1:71993017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B100,B110
`Chr1:71993047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B25,C29
`Chr1:71993143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr1:71993194`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788940.1

771 aa

386

771

B_lectin

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF01453 B_lectin 89-161 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 488-749 aa PF00069 Pkinase 489-749 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788940.1`	Pfam	`PF01453`	B_lectin	Repeat	89	161	1.3e-13	52.0	D-mannose binding lectin
`XP_057788940.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	488	749	1e-46	160.1	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057788940.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	489	749	5.3e-49	167.7	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932957.1
CCTCAACATGCAGCAATGTCCTTCCACTCCATCCCCATCTCCATTTTCTTTCTCCTCTTTATTTCTACCGCATCATCATCACCACCACCACCACCACCTCAAAGAATCACCCAAGGCTCTTCCCTCACACCCAACACCACCACCTCCTCTTGGCCTTCCCCCTCCGCCCTCTACGCTTTCGGATTCTTCCCCCAAACCACCGTCAACCGCTCCGCCCCCGCCGTCGGCATCTTCCTCCCCGACAAAACTGCCGTCTGGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005855
ATGTCCTTCCACTCCATCCCCATCTCCATTTTCTTTCTCCTCTTTATTTCTACCGCATCATCATCACCACCACCACCACCACCTCAAAGAATCACCCAAGGCTCTTCCCTCACACCCAACACCACCACCTCCTCTTGGCCTTCCCCCTCCGCCCTCTACGCTTTCGGATTCTTCCCCCAAACCACCGTCAACCGCTCCGCCCCCGCCGTCGGCATCTTCCTCCCCGACAAAACTGCCGTCTGGACGCCACCAAGCCCCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788940.1
MSFHSIPISIFFLLFISTASSSPPPPPPQRITQGSSLTPNTTTSSWPSPSALYAFGFFPQTTVNRSAPAVGIFLPDKTAVWTPPSPTVPDDVVALHLTAEGRLVLRRSRGRDVDVISPSAAVIASASMLDNGNFVLYDSESRIIWQSFDHPTDTLLPGQRLLPGKELISDRGGGIFRLKMQVDGNLVQYPVNTPDTDRAGGNVSLNLDSDGRLYLLNGSAPLRNITRGELPTREFVNLMRLDAGGLFRIYSLSLNPPGDW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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