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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005524`

染色体: Chr01 坐标: 72122213-72125099 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005524`
名称	SmilChr01G005524
描述	syntaxin-81-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72122213 - 72125099 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005957`
GeneID	`131005957`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005957`
原始查询	`SmilChr01G005524`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	syntaxin-81-like
产物	syntaxin-81-like
Arabidopsis	`AT1G51740` (SYP81) syntaxin of plants 81 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841599] identity=69.8; qcov=1; evalue=2.24e-145; confidence=high
Rice	`Os04g0530400` - identity=65.1; qcov=1; evalue=7.52e-140; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0006890 (retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum); GO:0016020 (membrane); GO:0031201 (SNARE complex)
KEGG	smil04130 (SNARE interactions in vesicular transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF10496 (Syntaxin-18_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005957

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057789067.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057789067.1`
3	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057789067.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057789067.1`
5	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057789067.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72122311`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B127,B50,C30,C86,D4
`Chr1:72122549`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,B50,C40,C50,C82
`Chr1:72122632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C74
`Chr1:72122751`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B3
`Chr1:72122751`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B3
`Chr1:72122826`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B11,B129,B3,B70,B73,B98,C50,C74
`Chr1:72124096`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr1:72124275`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B127,B136,B59,B90
`Chr1:72124537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C42,D6
`Chr1:72124579`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B140,B4,C8,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789067.1

317 aa

158

317

Syntaxin-18_N

PF10496 Syntaxin-18_N 5-86 aa

XP_057789068.1

317 aa

158

317

Syntaxin-18_N

PF10496 Syntaxin-18_N 5-86 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789067.1`	Pfam	`PF10496`	Syntaxin-18_N	Domain	5	86	1.8e-15	57.7	SNARE-complex protein Syntaxin-18 N-terminus
`XP_057789068.1`	Pfam	`PF10496`	Syntaxin-18_N	Domain	5	86	1.8e-15	57.7	SNARE-complex protein Syntaxin-18 N-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933084.1
GTCGAGTGTACATTTTTCCCAATTTCAAACCCTAATTTTTCATAATAAATTTTGTTTAGGAAGAAAAAAAAAACAATTTTACTCATGCTTGATTGAGAAGTTACTCATCTCTTACCAAATCGTTTTCTTGTCTAGAAGTGCGGTTTTGAGAGAAGGTTACTCCACCCCAGCTAAATAGAATTTGAAGGCATGGCAAAAGTTAGAGATAGAACTGAGGATTTGAAGGATGCTGCACGCCGAGCTGCGCTGAATTTGGGATA...

XM_057933085.1
TTCTCTCTCCCATTTGAAAAACCTCGTTTCTTTTAGCTTTTGGATGTGTATATTCAGCTGAGTAGATTGCTGTCTGTTGAGAAATCGCCAACTTTAATGCGATTTTGCCTATAATTTTTACGGATTCGGAATATTTGTAGCGTTAATTGTGAATCTGCAGACTGTAGCTGTTTTTCGTATCAGTGGGTTTGAAGAAGGTTACTCCACCCCAGCTAAATAGAATTTGAAGGCATGGCAAAAGTTAGAGATAGAACTGAGGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005957
ATGGCAAAAGTTAGAGATAGAACTGAGGATTTGAAGGATGCTGCACGCCGAGCTGCGCTGAATTTGGGATATGATGAGTCCAAAATTGCGACTATAATGGCGTCTTTTATCATGCATAAATCTTTGGAAAGGTCATCTTTCACCAAAGCTGCACTAACAACGCTTGAAAGTATTAGAGCTTTAGAGCAGTTCCTATTGAAGCATAAGAAGGATTACATAGATGTGCACCGTATTACGGAACAAGAGAGGGATGGCATTGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057789067.1
MAKVRDRTEDLKDAARRAALNLGYDESKIATIMASFIMHKSLERSSFTKAALTTLESIRALEQFLLKHKKDYIDVHRITEQERDGIEHEVTVFIKACKEQIDVLKNRINDEEANSKGWLGLRSDNLNADTIAHKHGVVLILSEKLHSVTSQFDQLRAVRFRDAINRVTPRRKVKQSNPTAVAESSTSGYIEHREVNNSEVRQTDDVQAEPIRFQQQQLDDETHALQVELASMLDAVRDTETKMVEMSALNHLMSTHVLQQ...

XP_057789068.1
MAKVRDRTEDLKDAARRAALNLGYDESKIATIMASFIMHKSLERSSFTKAALTTLESIRALEQFLLKHKKDYIDVHRITEQERDGIEHEVTVFIKACKEQIDVLKNRINDEEANSKGWLGLRSDNLNADTIAHKHGVVLILSEKLHSVTSQFDQLRAVRFRDAINRVTPRRKVKQSNPTAVAESSTSGYIEHREVNNSEVRQTDDVQAEPIRFQQQQLDDETHALQVELASMLDAVRDTETKMVEMSALNHLMSTHVLQQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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