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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005528`

染色体: Chr01 坐标: 72142532-72145796 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005528`
名称	SmilChr01G005528
描述	uncharacterized SmilChr01G005528
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72142532 - 72145796 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005927`
GeneID	`131005927`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005927`
原始查询	`SmilChr01G005528`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	replication factor C subunit, putative (DUF620) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830469]; symbol=AT5G05840; hit=AT5G05840; species=arabidopsis; confidence=high
产物	replication factor C subunit, putative (DUF620) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830469]; symbol=AT5G05840; hit=AT5G05840; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G05840` (AT5G05840) replication factor C subunit, putative (DUF620) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830469] identity=64.7; qcov=0.975; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0267500` - identity=61.1; qcov=1.01; evalue=4e-171; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04788 (DUF620)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005927

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057789031.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057789031.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057789031.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057789031.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789031.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72142655`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	C11,C69,C74
`Chr1:72142655`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	3	C11,C69,C74
`Chr1:72142694`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C67
`Chr1:72142694`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C67
`Chr1:72142759`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B80
`Chr1:72142803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B80
`Chr1:72142853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:72142975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B83,C47,C74
`Chr1:72142994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B58,B65,C20,C4,C86
`Chr1:72143008`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C47
`Chr1:72143008`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C47
`Chr1:72143011`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789031.1

401 aa

200

401

DUF620

PF04788 DUF620 119-364 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789031.1`	Pfam	`PF04788`	DUF620	Domain	119	364	1.2e-121	405.4	Protein of unknown function (DUF620)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933048.1
CAGCATAAACTAAGCCCCCCCACGTTGCTTAAGCCCCACTCTCTCTATTTCTTCACATACAAATTCTCTCAAATCCTTTCTCCCACTCCTAGCTACTTCCCACCATTCCCCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTACAATGAGAACTTTGTGTCCGAACTTGGACAGGGAAGACGGCCTCGACACGGTGCTGGAGGTTCCGATCCCGGAGGAAATGCTCGCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005927
ATGAGAACTTTGTGTCCGAACTTGGACAGGGAAGACGGCCTCGACACGGTGCTGGAGGTTCCGATCCCGGAGGAAATGCTCGCTTCCAACAAGCACACGTCGTGGCAGAGCATGAAGTCGTGGATGACGCGGCCCGCCGCGGCCGCCGCCTCCGTCTTTGGCGGCCGCGCAGCCGAGATTCAGTTCCTGCTCGGAGTCGTCGGAGCCCCCCTCATACCCCTGCCCATCCGCTGCGACCGCACCGTCAACAACAACATCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789031.1
MRTLCPNLDREDGLDTVLEVPIPEEMLASNKHTSWQSMKSWMTRPAAAAASVFGGRAAEIQFLLGVVGAPLIPLPIRCDRTVNNNIKGCPIESSMAKYIVQQYIAAAGGEHALNGIDSMYAMGKVKMAASEFVSGDAKVKNMARHGAGEMGGFVLWQKRPDLWSLELMVAGYKISAGSDGKVAWRQTPWQNSHASRGPPRPLRRSLQGLDPRSTANLFSNSICIGEKSINGKDCFVLKLEAEAPTLRARSSSNVEIMRHT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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