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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005542`

染色体: Chr01 坐标: 72239299-72239697 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005542`
名称	SmilChr01G005542
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase 13-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72239299 - 72239697 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012648`
GeneID	`131012648`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012648`
原始查询	`SmilChr01G005542`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase 13-like
产物	glucan endo-1%2C3-beta-glucosidase 13-like
Arabidopsis	`AT3G55780` (AT3G55780) Glycosyl hydrolase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824744] identity=53.9; qcov=0.674; evalue=2.88e-26; confidence=medium
Rice	`Os03g0669300` (OSJNBa0039O18.8) - identity=37.7; qcov=0.864; evalue=2.25e-18; confidence=low
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00332 (Glyco_hydro_17)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012648

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057796616.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796616.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796616.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796616.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796616.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72239314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr1:72239327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr1:72239384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:72239422`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C23
`Chr1:72239427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C23
`Chr1:72239431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:72239432`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C23
`Chr1:72239442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C23
`Chr1:72239449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr1:72239452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr1:72239545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,B40,B47,B79,C62
`Chr1:72239548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B140,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796616.1

132 aa

132

Glyco_hydro_17

PF00332 Glyco_hydro_17 25-121 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796616.1`	Pfam	`PF00332`	Glyco_hydro_17	Domain	25	121	1.2e-11	45.5	Glycosyl hydrolases family 17

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940633.1
ATGCCTTCTCTCCACCTTATCACTTCCATCCTCCTCCTTCTTTCCACCGCCGCCGCCGCCACCACCGTAGACGTCACATACAACCCCTCCGCCCCCAACCTCTCCCCGCCTGAACGCGTAGTCTCCACGCTCCAATCCCTCCGTATCTCCGCCGTCCGCCTCCTCGATCCGTCCGCCGCCGTCGTCCGCGCCTTCGCCTACACCAACATCACCCTTCTCCTCACCGTCCCCAACCACCTCATCCCCTCCTTCGCCGCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012648
ATGCCTTCTCTCCACCTTATCACTTCCATCCTCCTCCTTCTTTCCACCGCCGCCGCCGCCACCACCGTAGACGTCACATACAACCCCTCCGCCCCCAACCTCTCCCCGCCTGAACGCGTAGTCTCCACGCTCCAATCCCTCCGTATCTCCGCCGTCCGCCTCCTCGATCCGTCCGCCGCCGTCGTCCGCGCCTTCGCCTACACCAACATCACCCTTCTCCTCACCGTCCCCAACCACCTCATCCCCTCCTTCGCCGCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796616.1
MPSLHLITSILLLLSTAAAATTVDVTYNPSAPNLSPPERVVSTLQSLRISAVRLLDPSAAVVRAFAYTNITLLLTVPNHLIPSFAANRSAAALWLHLHVLPYHPRTRISLISTGSDVVITTFYSPLILLLFL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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