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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005543`

染色体: Chr01 坐标: 72244774-72246342 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005543`
名称	SmilChr01G005543
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-17
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72244774 - 72246342 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005984`
GeneID	`131005984`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005984`
原始查询	`SmilChr01G005543`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-17
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-17
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=33.3; qcov=0.682; evalue=4.67e-16; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=30.9; qcov=0.616; evalue=5.64e-15; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005984

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057789109.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057789109.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789109.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789109.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789109.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72245329`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	11	A18,B127,B139,B40,B45,B47,B76,B79,C57,C62,C82
`Chr1:72245344`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B28,C80
`Chr1:72245344`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B28,C80
`Chr1:72245356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B78,B97
`Chr1:72245391`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B99,C15,C58,C75
`Chr1:72245495`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	B10,B136,B51,B61,C31,C34,C71,D6
`Chr1:72245506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr1:72245713`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C74
`Chr1:72245713`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C74
`Chr1:72245752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B99,C15,C58
`Chr1:72245820`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B104
`Chr1:72245820`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789109.1

242 aa

121

242

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 147-232 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789109.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	147	232	3.6e-18	66.4	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933126.1
TCGTGTTAACTGATTACGCATTTGTAACATCAAGTTGCAATACTATATCAAGTTTATGGTTGAATTGATCTTTCAAATTTGACAAATTAACACTCCACCTTTTTCATATCTGCAGATGGAAAAGCTCCAATTCTCATTTTGATTCACACTACCCTGTGTATTGTCTTTGCATTTTTGCAAGAATCAAGACGAGATTAGAGACCATGGCTGCTTATGCAGCTCTGGTTTCTCTCATGCATACTATAGATGATATCAAGGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005984
ATGGCTGCTTATGCAGCTCTGGTTTCTCTCATGCATACTATAGATGATATCAAGGCTCATCCTTCTCCTCCAATTTCCCTCCCCAATCAACAAGTTCAATCTCTCACTGAAAAGCTCAACTTCATGCTAGGGTTCCTCGAGGGCTGTAATATTCAGCTCGATGATGAACAAACAAGTTGCACCCACTTTCATCAACATCTACAGAAAGTGATAGAAGAGATGGATTTGATCAAGACGAAGGCAGAGAAGAAGGCTGCAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789109.1
MAAYAALVSLMHTIDDIKAHPSPPISLPNQQVQSLTEKLNFMLGFLEGCNIQLDDEQTSCTHFHQHLQKVIEEMDLIKTKAEKKAAVEAHELHRNISDHRGRVGSISRKRKSPMVGLDDVLPQLMDKLVGGDPNRQIVPIVGMAGIVSQNYNVGEALGEIISQVGEERGENGGELGEELHKYLFGRRYLVVMDDMWSIEAWDRMKVFFPYDGNGSRILVTTRLSNLAAHLSKSNTLDMRKTW

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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