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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005570`

染色体: Chr01 坐标: 72475192-72477490 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005570`
名称	SmilChr01G005570
描述	probable fructokinase-4
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72475192 - 72477490 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005955`
GeneID	`131005955`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005955`
原始查询	`SmilChr01G005570`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable fructokinase-4
产物	probable fructokinase-4
Arabidopsis	`AT3G59480` (AT3G59480) pfkB-like carbohydrate kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825117] identity=80.1; qcov=0.981; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0894300` (OsFKI) - identity=70.2; qcov=0.975; evalue=2.57e-164; confidence=high
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0006000 (fructose metabolic process); GO:0008865 (fructokinase activity)
KEGG	smil00051 (Fructose and mannose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00500 (Starch and sucrose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00520 (Amino sugar and nucleotide sugar metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01250 (Biosynthesis of nucleotide sugars - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00294 (PfkB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005955

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057789063.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057789063.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057789063.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057789063.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789063.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72475432`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B24,B85,C10,C19,C4
`Chr1:72475432`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B24,B85,C10,C19,C4
`Chr1:72475446`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B117,B20,B40,D6
`Chr1:72475486`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C6
`Chr1:72475502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr1:72475556`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B33,C80,D2
`Chr1:72475664`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,C64,C66
`Chr1:72476383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B33,C80,D2
`Chr1:72476411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,C35,D10,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789063.1

323 aa

162

323

PfkB

PF00294 PfkB 9-314 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789063.1`	Pfam	`PF00294`	PfkB	Domain	9	314	1.3e-71	242.1	pfkB family carbohydrate kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933080.1
CTACACAATTCCTTGAAGCAAATAGGCACATATATATTTACTTAAATATTTTTTTTTACTTCCATACTACAGCAATGACGGTAGCAGAAAGCAGAGGTTTGATTGTGAGCTTCGGCGAGATGTTGATCGACTTTGTCCCGACGGTCTCCGGCGTGTCGCTGGCGGAGGCGCCGGGTTTCATCAAGGCTCCCGGCGGCGCTCCGGCCAACGTGGCCATCGCCGTGGCGAGACTCGGTGGAAATTGCGCCTTCATCGGCAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005955
ATGACGGTAGCAGAAAGCAGAGGTTTGATTGTGAGCTTCGGCGAGATGTTGATCGACTTTGTCCCGACGGTCTCCGGCGTGTCGCTGGCGGAGGCGCCGGGTTTCATCAAGGCTCCCGGCGGCGCTCCGGCCAACGTGGCCATCGCCGTGGCGAGACTCGGTGGAAATTGCGCCTTCATCGGCAAGCTCGGCGACGACGAGTTCGGCCACATGCTCGCCGGAATCCTCAAGGAGAACGGCGTCTCCACCGCCGGGGTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789063.1
MTVAESRGLIVSFGEMLIDFVPTVSGVSLAEAPGFIKAPGGAPANVAIAVARLGGNCAFIGKLGDDEFGHMLAGILKENGVSTAGVNLDKGARTALAFVTLCADGEREFMFYRNPSADMLLTPDELNLELIKSAKVFHYGSISLIVEPCRSAHLKAMEVARDAGALLSYDPNLRLPLWPSPEEAREQIMSIWDKADVIKVSDEELSFLVQRDEVDDDAAMSLYHDNLKLLLVTLGAMGCRYYTKHFRGTIEGFCVDTIDT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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