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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005585`

染色体: Chr01 坐标: 72537691-72539146 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005585`
名称	SmilChr01G005585
描述	uncharacterized SmilChr01G005585
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72537691 - 72539146 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005944`
GeneID	`131005944`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005944`
原始查询	`SmilChr01G005585`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Oshsp17.9A; symbol=Oshsp17.9A; hit=Os03g0266300; species=rice; confidence=low
产物	Oshsp17.9A; symbol=Oshsp17.9A; hit=Os03g0266300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G53540` (AT1G53540) HSP20-like chaperones superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841789] identity=47.8; qcov=0.454; evalue=1.35e-37; confidence=medium
Rice	`Os03g0266300` (Oshsp17.9A) - identity=62.7; qcov=0.318; evalue=6.48e-38; confidence=low
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0009408 (response to heat); GO:0009651 (response to salt stress); GO:0042542 (response to hydrogen peroxide); GO:0043621 (GO:0043621); GO:0051082 (GO:0051082); GO:0051259 (protein complex oligomerization)
KEGG	-
Pfam	PF00011 (HSP20); PF01107 (MP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005944

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057789051.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057789051.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057789051.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789051.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789051.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72537870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B3,B84,C84
`Chr1:72537920`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B84,C14,C63
`Chr1:72537926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C61
`Chr1:72537956`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B131,B19,B53,B57
`Chr1:72537956`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B131,B19,B53,B57
`Chr1:72537964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B19,B53,B57
`Chr1:72537970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,B64
`Chr1:72538003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B19,B53,B57
`Chr1:72538018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B19,B53,B57
`Chr1:72538057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B19,B53,B57
`Chr1:72538096`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr1:72538108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789051.1

346 aa

173

346

HSP20

PF01107 MP 38-177 aa PF00011 HSP20 240-344 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789051.1`	Pfam	`PF01107`	MP	Family	38	177	9.2e-14	52.2	Viral movement protein (MP)
`XP_057789051.1`	Pfam	`PF00011`	HSP20	Domain	240	344	6.3e-24	84.7	Hsp20/alpha crystallin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933068.1
TTCCATTCCCACTTTAAGCTAGCTTTCATTTCATTATAGTTTGCTCACAGTAAGAGATGATGTTAGAGTGATCGATGTTCAGGTAAGTCTACTCTTCCATTTCTGATTATTGATAATTAATCTTAGCCAATAATTGAATTTTGAGATCATGAACTCTGCAAAAATTGAAAAATCTCTTCGAGATTGGAAACTGCCCCCATCTTCACCCTCGGATGTCTTTAAGCGAAGACGTTTCCTCAATTTTTCTTCTGAACCTTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005944
ATGAACTCTGCAAAAATTGAAAAATCTCTTCGAGATTGGAAACTGCCCCCATCTTCACCCTCGGATGTCTTTAAGCGAAGACGTTTCCTCAATTTTTCTTCTGAACCTTCTTGTATAATCAAAACCGTAGAGAAAGAAATTCCCTTATCTGAGGAATACGCATCGTTTCCTCTCTTCACCGATCATCTTCAAAGAGTTTACAAAAACCAATACGCCTACCTTCATATGGGAATGATTCAGGTGGGTGTGAAACCTACGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789051.1
MNSAKIEKSLRDWKLPPSSPSDVFKRRRFLNFSSEPSCIIKTVEKEIPLSEEYASFPLFTDHLQRVYKNQYAYLHMGMIQVGVKPTKLGSNTSVIISLRDKRFLKFDESLLGLVESSLCDGPIYFSYFPTHFVSLSDPHLSETFTIDIKTQGCSKDENVILMYKFHYKATNSNNIDEKNVSRSLVDGDRETTLFLTNIFGGRNRVVSKKIYWDQVSLPEAWMDRNDGGGGSVSSGEARIDWKEAAEAHVLKVDVPGFKKG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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