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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005609`

染色体: Chr01 坐标: 72636647-72642070 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005609`
名称	SmilChr01G005609
描述	guanylyl cyclase 1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72636647 - 72642070 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005969`
GeneID	`131005969`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005969`
原始查询	`SmilChr01G005609`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	guanylyl cyclase 1
产物	guanylyl cyclase 1
Arabidopsis	`AT5G05930` (GC1) guanylyl cyclase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830478] identity=56.9; qcov=0.971; evalue=5.56e-104; confidence=high
Rice	`Os05g0453500` - identity=38.6; qcov=0.367; evalue=3.41e-14; confidence=low
GO	-
KEGG	smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF09778 (Guanylate_cyc_2); PF13529 (Peptidase_C39_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005969

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057789086.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057789086.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789086.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789086.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789086.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72638426`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,D10
`Chr1:72638672`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:72640621`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C5,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789086.1

276 aa

138

276

Peptidase_C39_2

Guanylate_cyc_2

PF13529 Peptidase_C39_2 53-239 aa PF09778 Guanylate_cyc_2 54-259 aa

XP_057789087.1

275 aa

138

275

Peptidase_C39_2

Guanylate_cyc_2

PF13529 Peptidase_C39_2 53-238 aa PF09778 Guanylate_cyc_2 54-258 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789086.1`	Pfam	`PF13529`	Peptidase_C39_2	Domain	53	239	1.6e-09	39.1	Peptidase_C39 like family
`XP_057789086.1`	Pfam	`PF09778`	Guanylate_cyc_2	Family	54	259	3.7e-75	252.7	Guanylylate cyclase
`XP_057789087.1`	Pfam	`PF13529`	Peptidase_C39_2	Domain	53	238	1.9e-09	38.8	Peptidase_C39 like family
`XP_057789087.1`	Pfam	`PF09778`	Guanylate_cyc_2	Family	54	258	7.2e-75	251.7	Guanylylate cyclase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933104.1
CAGCTTCCCGAAAGGCGCCTCTCTTACCCCACGCCCACCAACACCACCCACCACCCCACCCACCCACCCACCTCACCTCACCTCACCTCCCAGCACCCACCCCGCCAACGCCAAAAATGTCTGTTTAGAGCAAAAGGAGCAACAGAATCTGAATGAATTATCAATATCCTGCTTTTCTCTCATAGGCCTATTCATATTATTTGTCTCTGCATTTTTCACACCAAAAAAGACACCATTTTTAGGGACAGTGCTGCCGGAAG...

XM_057933103.1
CAGCTTCCCGAAAGGCGCCTCTCTTACCCCACGCCCACCAACACCACCCACCACCCCACCCACCCACCCACCTCACCTCACCTCACCTCCCAGCACCCACCCCGCCAACGCCAAAAATGTCTGTTTAGAGCAAAAGGAGCAACAGAATCTGAATGAATTATCAATATCCTGCTTTTCTCTCATAGGCCTATTCATATTATTTGTCTCTGCATTTTTCACACCAAAAAAGACACCATTTTTAGGGACAGTGCTGCCGGAAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005969
ATGTGGTCAATTCATCACTTCATGAACAAACTAATGAAGGCGGTGGAAGAAAATTTTGACGAGACTGCTGAAAATCACTTTAACTTTGTTGATTCTTATACCATCCAGCAGTCACCAAACAACCAGAGTAGGACTTCAGTCTCGTCCTACTTTGTTGATGTACCTCACATAAATCAGCAAAACACATGGGATTGTGGTCTTGCTTGTGTTCTTATGGTTTTGCAAGCTGTTGGTGTATATGAATGTACAATTCAAGAACT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057789086.1
MWSIHHFMNKLMKAVEENFDETAENHFNFVDSYTIQQSPNNQSRTSVSSYFVDVPHINQQNTWDCGLACVLMVLQAVGVYECTIQELEELCCTTSIWTVDLAYLLQKFSVSFTYCTVTLGANPDFSVETYYKDQLPNDLRRVNMLFQEAREAGISIQCRSVSAKEISDFILSGKYVAIALVDQHKLSSQSQLEDICVSDYYSGGPSYTGHYVVICGYDASTDEFEIRDPASSRKHERVPSWCLEQAHKSFGTDEDFLLIS...

XP_057789087.1
MWSIHHFMNKLMKAVEENFDETAENHFNFVDSYTIQQSPNNQSRTSVSSYFVDVPHINQQNTWDCGLACVLMVLQAVGVYECTIQELEELCCTTSIWTVDLAYLLQKFSVSFTYCTVTLGANPDFSVETYYKDQLPNDLRRVNMLFQEAREAGISIQCRSVSAKEISDFILSGKYVAIALVDQHKLSQSQLEDICVSDYYSGGPSYTGHYVVICGYDASTDEFEIRDPASSRKHERVPSWCLEQAHKSFGTDEDFLLISI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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