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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005610`

染色体: Chr01 坐标: 72648694-72652315 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005610`
名称	SmilChr01G005610
描述	rop guanine nucleotide exchange factor 5
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72648694 - 72652315 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005888`
GeneID	`131005888`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005888`
原始查询	`SmilChr01G005610`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rop guanine nucleotide exchange factor 5
产物	rop guanine nucleotide exchange factor 5
Arabidopsis	`AT5G05940` (ROPGEF5) ROP guanine nucleotide exchange factor 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830479] identity=61; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0849100` (OsRacGEF1) - identity=66.7; qcov=0.821; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005085 (guanyl-nucleotide exchange factor activity)
KEGG	-
Pfam	PF03759 (PRONE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005888

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057788983.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057788983.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057788983.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788983.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788983.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72649192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:72649199`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,C20
`Chr1:72649332`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	B103,B125,B15,B41,B44,B69,B74,B91,C24,C33,C44,C70,C77,C81
`Chr1:72649335`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	B103,B125,B15,B41,B44,B69,B74,B91,C24,C33,C44,C70,C77,C81
`Chr1:72650374`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr1:72650897`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr1:72650930`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B99,C11,C58,C69
`Chr1:72650951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B4,B66,C23
`Chr1:72650999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:72651017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,C5
`Chr1:72651024`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B98,C16
`Chr1:72651056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B65,C20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788983.1

560 aa

280

560

PRONE

PF03759 PRONE 66-434 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788983.1`	Pfam	`PF03759`	PRONE	Family	66	434	2.6e-178	593.1	PRONE (Plant-specific Rop nucleotide exchanger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933000.1
AACTAAAATGAAGATGGAGGTACTTGGAATAAAATCCAAAAAAGGGATGAATTTTAATGTCGAAATCATCCCTTTGAATTTCATACACCAAAATTTGAATGTGCTTCAAATCCATGTGCAAACAAAAGAAAATAGACGTTGGATTTGGCACAACACAAGGCAGTTTATCTCAACCCCCTGAAAAAATCAAAAATCGAAATTTCTGCAACAAAAACACACAGTCCCCACACTATCAGAGAATAAAATCACTGTGCCCAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005888
ATGGAGAAGAAAGATGGGACTGAGGCAAGAGGTAGTAGCAGACCGAGTTCCGATGATAATTCTTCTTCGACTCAATTTGGATGGCCGATTGGAAAGACGGGAAATTCTATGAAAGTTGAAGGCAAAAGCAAGCCTTGTTTGAATGTTGAGAGTGGTGATGATAAATCCGGGGGTAAAAAGCAGGGTTCTAAATATTCAGAAATTGAGATGATGAAAGAGCGGTTTGCAAAGCTGTTGCTTGGTGAAGATATGTCAGGAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788983.1
MEKKDGTEARGSSRPSSDDNSSSTQFGWPIGKTGNSMKVEGKSKPCLNVESGDDKSGGKKQGSKYSEIEMMKERFAKLLLGEDMSGSGKGVCPALTISNAITNLCASVFGQLWRLEPLPPEKRSMWRREMGWLLSVSDHIVELKPSWQTFANGGRVEVMSCQPRSDLFINLPALQKLDNMLLEILDGFSKTEFWYVDQGIVAPEADGSVSFQKAVQRQEEKWWLPVPRVPPGGLPEAARKLLSHKLESANQILKAATAIN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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