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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005611`

染色体: Chr01 坐标: 72653226-72654251 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005611`
名称	SmilChr01G005611
描述	uncharacterized SmilChr01G005611
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72653226 - 72654251 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006027`
GeneID	`131006027`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006027`
原始查询	`SmilChr01G005611`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824565]; symbol=AT3G53980; hit=AT3G53980; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824565]; symbol=AT3G53980; hit=AT3G53980; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G53980` (AT3G53980) Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824565] identity=67.5; qcov=1; evalue=3.83e-50; confidence=medium
Rice	`Os01g0849000` (OsLTPd5) - identity=68.5; qcov=0.807; evalue=7.05e-42; confidence=medium
GO	GO:0005504 (fatty acid binding); GO:0009627 (systemic acquired resistance)
KEGG	-
Pfam	PF00234 (Tryp_alpha_amyl); PF14368 (LTP_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006027

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057789165.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057789165.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789165.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789165.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789165.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72653446`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,D11
`Chr1:72653449`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B46
`Chr1:72653459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr1:72653463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B48,D11
`Chr1:72653524`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:72653545`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,C40,C50
`Chr1:72653556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr1:72653631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr1:72653660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,B6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789165.1

114 aa

114

LTP_2

Tryp_alpha_amyl

PF14368 LTP_2 20-104 aa PF00234 Tryp_alpha_amyl 36-108 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789165.1`	Pfam	`PF14368`	LTP_2	Family	20	104	6.8e-10	39.7	Probable lipid transfer
`XP_057789165.1`	Pfam	`PF00234`	Tryp_alpha_amyl	Domain	36	108	4.2e-09	37.2	Protease inhibitor/seed storage/LTP family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933182.1
TATTTGAGCTCCCCACTAAAATGGTGGATTTCCACTCGTCCAATTTCGACACTAAACCCTTCCCAAAACTCAGCACTATATAAACACCACGCCATCTCGTGTTATTACAAACCATCACTAACAACAACAACAACAATAACGACATTGTTATCACCGAGAAAATCGAGTTGAGAAAAATGGGAGTGTCGATCAAGTGGCTCTGCGCTCTGGCATTCCTCGCGATCGTCGGGATCGCGGCGGATGCAGCGGGCGAGTGCCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006027
ATGGGAGTGTCGATCAAGTGGCTCTGCGCTCTGGCATTCCTCGCGATCGTCGGGATCGCGGCGGATGCAGCGGGCGAGTGCCCGAAGTCGACGCCGGACATGGAGGCGATGAAGCTGATCCCGTGCGCGTCGGCGGCGCAGGACCCGAACGCGGCGGTTCCGGCGAGCTGCTGCGCTCAGGTGAAGCGGCTGGGGCAGAATCCGAAATGCATGTGCGCCGTGATGCTGTCGAACACCGCCAAGAGCTCCGGCGTGAAGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789165.1
MGVSIKWLCALAFLAIVGIAADAAGECPKSTPDMEAMKLIPCASAAQDPNAAVPASCCAQVKRLGQNPKCMCAVMLSNTAKSSGVKPEVALTIPKRCNFADRPVGYKCGPYTLP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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