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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005618`

染色体: Chr01 坐标: 72677249-72680023 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005618`
名称	SmilChr01G005618
描述	protein DA1-related 2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72677249 - 72680023 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005895`
GeneID	`131005895`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005895`
原始查询	`SmilChr01G005618`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein DA1-related 2
产物	protein DA1-related 2
Arabidopsis	`AT2G39830` (DAR2) DA1-related protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818570] identity=66.6; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0267800` - identity=60.6; qcov=0.972; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0043130 (ubiquitin binding)
KEGG	-
Pfam	PF00412 (LIM); PF12315 (DA1-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005895

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057788998.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057788998.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057788998.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788998.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788998.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72677598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C2
`Chr1:72677607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr1:72677616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B112,C35
`Chr1:72677643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B59,B98,C27,C37
`Chr1:72677737`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D3
`Chr1:72677737`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D3
`Chr1:72678902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,C34
`Chr1:72679566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr1:72679617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B122,B132,B66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788998.1

509 aa

254

509

LIM

DA1-like

PF00412 LIM 137-191 aa PF12315 DA1-like 286-504 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788998.1`	Pfam	`PF00412`	LIM	Domain	137	191	6.4e-08	33.4	LIM domain
`XP_057788998.1`	Pfam	`PF12315`	DA1-like	Family	286	504	1.1e-95	319.8	Protein DA1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933015.1
GATGACCACTCTCGAGCCAATAAAGAAAAGGAAGAATTAGATCGTGCAGTAGCTCTCTCTTTGAATGAAGATTTAAGCAAACCAAATGGATATAGATGGAGAACAGCCAACGATGAAGATCTAGCGAGGACACTTCACGATAATTTCAACTCAGCACCGTACCCTCAGTATGGCCCTAGAGATTATTACCAGGAGGCCTATAGAAAATGTGGAGGTTGTGATCGTGAAATCGTGCATGGAAATTATCTGGGATGCATGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005895
GATGACCACTCTCGAGCCAATAAAGAAAAGGAAGAATTAGATCGTGCAGTAGCTCTCTCTTTGAATGAAGATTTAAGCAAACCAAATGGATATAGATGGAGAACAGCCAACGATGAAGATCTAGCGAGGACACTTCACGATAATTTCAACTCAGCACCGTACCCTCAGTATGGCCCTAGAGATTATTACCAGGAGGCCTATAGAAAATGTGGAGGTTGTGATCGTGAAATCGTGCATGGAAATTATCTGGGATGCATGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788998.1
MSSSNVNHLAQPCIYGHIVSSYGERKSTFMRWLSKLFKGGASRRRAATGGQQPGDGNVVLRAPSRSSDDHSRANKEKEELDRAVALSLNEDLSKPNGYRWRTANDEDLARTLHDNFNSAPYPQYGPRDYYQEAYRKCGGCDREIVHGNYLGCMGTFYHPECFCCCACGYPITEHEFSLSGKDTYHKSCFKELTHPKCEVCHQFIPTNGAGLIEYRCHPFWSQKYCPSHEHDNTARCCSCERLESWNTRYISLGDSRSICL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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