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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005638`

染色体: Chr01 坐标: 72811430-72817112 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005638`
名称	SmilChr01G005638
描述	uncharacterized SmilChr01G005638
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72811430 - 72817112 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005901`
GeneID	`131005901`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005901`
原始查询	`SmilChr01G005638`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycosyltransferase (DUF604) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818350]; symbol=AT2G37730; hit=AT2G37730; species=arabidopsis; confidence=high
产物	glycosyltransferase (DUF604) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818350]; symbol=AT2G37730; hit=AT2G37730; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G37730` (AT2G37730) glycosyltransferase (DUF604) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818350] identity=50.4; qcov=0.849; evalue=2.68e-156; confidence=high
Rice	`Os03g0269900` - identity=52.2; qcov=0.878; evalue=6.88e-142; confidence=high
GO	GO:0008375 (acetylglucosaminyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02434 (Fringe); PF04646 (DUF604)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005901

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057789004.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057789004.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789004.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789004.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789004.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72812318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,D10
`Chr1:72812333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B98,C27,C64,C66
`Chr1:72812349`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,C7,C71,C83,C84
`Chr1:72812420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,C21
`Chr1:72812459`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:72812471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:72812527`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B139,B80
`Chr1:72812606`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:72812696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,B80
`Chr1:72812721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B78
`Chr1:72812732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B35,C19
`Chr1:72815971`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789004.1

498 aa

249

498

Fringe

DUF604

PF02434 Fringe 177-283 aa PF04646 DUF604 219-472 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789004.1`	Pfam	`PF02434`	Fringe	Domain	177	283	2.1e-09	37.8	Fringe-like
`XP_057789004.1`	Pfam	`PF04646`	DUF604	Family	219	472	6.8e-112	373.7	Protein of unknown function, DUF604

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933021.1
TAAGATACGTCAAAGACCCAAAAAAACTGTCTTTAAAGGCGTCAACTCCACTAAGTCCATTTATTTCCACTGATGCCCATACGTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCACTAAAAACACATTTTAGGGAGGGACACGACACGATACCCACACACACACCCATGTGAAAATTCACTCCACAAACCTCAAACCCTCCTCGCCAAATGCAATAAAAGCTTTCTGGTTTTTTCCATCAACACATTCTTGCTCAATTGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005901
ATGTTTTTCAAGATGTGCCCGGCGCCGGAAAATCCGGGTCAGGACCCGTTTAAAGCTCTGAAACCGATACTGAAAGAGAGGACCCGCGACGCGGTAACGACGTCGTTGAAGGCGGCGGTGGCGGCGATCCTAACCCTCTCCATCTCCCTCGCCGCATACTCCGCAATCTACGGCGCGATTCGACCCGATTTCTTCCGCTGGCCCGACCGCTCCGACCGACCCGACCCGGATTTATACATGGCTTTATTCAACTCCGACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789004.1
MFFKMCPAPENPGQDPFKALKPILKERTRDAVTTSLKAAVAAILTLSISLAAYSAIYGAIRPDFFRWPDRSDRPDPDLYMALFNSDDSPTNVSHLAFGIGGSTATWANRAVYSDLWWKPGSTRGYVFLEKDPGGPARGGIGRRVSSEWRRFRRTAGSESAVRIARVAADLFRVGLPNVRWLVMGDDDTVFFPENLAAVLGRHDHRRMVYVGGNSESVEQDVMHAYDMAFGGGGFAISYPLAAELAAAMDGCLNRYHYFYG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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