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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005649`

染色体: Chr01 坐标: 72882606-72884279 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005649`
名称	SmilChr01G005649
描述	protein ELC-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72882606 - 72884279 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005928`
GeneID	`131005928`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005928`
原始查询	`SmilChr01G005649`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ELC-like
产物	protein ELC-like
Arabidopsis	`AT3G12400` (ELC) Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820419] identity=56.5; qcov=1.01; evalue=1.22e-155; confidence=high
Rice	`Os02g0833300` - identity=52.1; qcov=1.01; evalue=7.4e-138; confidence=high
GO	GO:0000813 (ESCRT I complex); GO:0008333 (endosome to lysosome transport); GO:0015031 (protein transport); GO:0036211 (protein modification process); GO:0043130 (ubiquitin binding)
KEGG	smil03250 (Viral life cycle - HIV-1 - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03272 (Virion - Hepatitis viruses - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05743 (UEV); PF09454 (Vps23_core)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005928

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057789032.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057789032.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057789032.1`
4	Vesicle	囊泡	0.40000	`XP_057789032.1`
5	Endosome	内体	0.40000	`XP_057789032.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72882846`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr1:72882894`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B124,C61
`Chr1:72883083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr1:72883111`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C1
`Chr1:72883111`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C1
`Chr1:72883251`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:72883404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B53,B66,B7,C1,D2
`Chr1:72883519`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr1:72883539`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr1:72883602`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B2,B23,C36
`Chr1:72883649`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B92
`Chr1:72883649`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B92

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789032.1

398 aa

199

398

UEV

Vps23_core

PF05743 UEV 26-154 aa PF09454 Vps23_core 312-375 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789032.1`	Pfam	`PF05743`	UEV	Domain	26	154	4.6e-43	146.9	UEV domain
`XP_057789032.1`	Pfam	`PF09454`	Vps23_core	Domain	312	375	3.3e-26	91.7	Vps23 core domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933049.1
AAGTAGAAAACTCAATAAACGAAAAATCATTTATATATTTTTTTGAGAAAGGTAAATACTCCATTAGAAATCCCAGTCAGCTCCATCTTCTTCTTCTTCTCATTGTATACAAAAATCCCTGCAAATTCCTCGATGCTTACCACAGAAATCGAGATCTACAAATCCGCCTCAACGCGTTGCTGAGATCAAAATCAAATCGCTGAGATCAAAATCGAATCGCATGGCGCAATACACGCAGCAGTTCCTCAACAGCGTGCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005928
ATGGCGCAATACACGCAGCAGTTCCTCAACAGCGTGCTCTCGCAGCGGGGGCCGGCGGCGCTGCCGTACGCGGAGGACATGAAGTGGCACATCCGGCAGCACCTGATGCAGCTGGTGGAGGCCTACCCCTCCCTGCAGCCGAAGACCGCCGTCTTCACCCACAACGACGGCCGCACCGTCAACCTCCTCCAGGCCGACGGCACCGTCCCCATGTCCTTCCAGGGCGTCACCTACAACATCCCCGTCATCATCTGGCTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789032.1
MAQYTQQFLNSVLSQRGPAALPYAEDMKWHIRQHLMQLVEAYPSLQPKTAVFTHNDGRTVNLLQADGTVPMSFQGVTYNIPVIIWLMESYPRHAPLVFVNPTRDMIIKRPHPFVSPNGVVSIPYVHSWLFPSSNLVELARNLGHFFARDPPLYSQRKPSSPNPNPNPSPSPNLNSAYGSMNSSPAARPAIPPREYSPSPTPPPPYGSGRMEDPAEVYRKNAINRLVENLNGDIREMRKGSEGQMEGMFGAQAVLRRREEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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