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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005650`

染色体: Chr01 坐标: 72886878-72888021 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005650`
名称	SmilChr01G005650
描述	thaumatin-like protein
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72886878 - 72888021 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005964`
GeneID	`131005964`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005964`
原始查询	`SmilChr01G005650`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thaumatin-like protein
产物	thaumatin-like protein
Arabidopsis	`AT5G02140` (AT5G02140) Pathosis-related thaumatin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831881] identity=54.8; qcov=1; evalue=2.95e-98; confidence=high
Rice	`Os11g0706600` - identity=60.6; qcov=0.911; evalue=2.05e-90; confidence=high
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0006952 (defense response)
KEGG	-
Pfam	PF00314 (Thaumatin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005964

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057789078.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057789078.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057789078.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789078.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789078.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72887092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:72887202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:72887226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:72887235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr1:72887287`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr1:72887309`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr1:72887494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr1:72887504`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A7
`Chr1:72887504`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A7
`Chr1:72887511`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,B47
`Chr1:72887532`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	A15,A3,B114,B117,B125,B20,B23,B40,B52,B70,B90,B92,C20,C30,C87
`Chr1:72887534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789078.1

248 aa

124

248

Thaumatin

PF00314 Thaumatin 29-246 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789078.1`	Pfam	`PF00314`	Thaumatin	Domain	29	246	3.8e-76	256.1	Thaumatin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933095.1
AAAAACTGCATTATGCCACTTAACCGTCTTCTCTCTCTACCTCCATAAATCTCCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTTCATCTTCTCTCTCAAATTATTTTCAAGCTCAGAGCAAGCAAACATGCCTACTTCAATCCTATACTTCTCTCTCATTTTCTTCTTCACCTCCTTCCTCTCCACCGATGGAACTCAGCTGATCGTGGCGAACAACTGCAAGGAGCAAATCTGGCCGGCGATCCTCGGCAACTCCGGCCACGACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005964
ATGCCTACTTCAATCCTATACTTCTCTCTCATTTTCTTCTTCACCTCCTTCCTCTCCACCGATGGAACTCAGCTGATCGTGGCGAACAACTGCAAGGAGCAAATCTGGCCGGCGATCCTCGGCAACTCCGGCCACGACACCCTCAACGACGGCGGCTTCCCGCTGGGCAGCGGGCAGCAGGTGGTGGTGGAGGCACCCCAGTGGTGGTCGGGCAGGATGTGGGCCCGGCAGGGGTGCTGCTTTGGCACGGCGGGCCCTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789078.1
MPTSILYFSLIFFFTSFLSTDGTQLIVANNCKEQIWPAILGNSGHDTLNDGGFPLGSGQQVVVEAPQWWSGRMWARQGCCFGTAGPGGPPCQTGDCGPGQMRCMGMAGQPPATVVEMTLGTPANPVHYYDVSLVDGFNLPVAMVPLGAAAAGCGAAACEADVNACCPEELAVRRGGRVVGCRSACLGVGGDRYCCTGQFGSPAACKPTSYSKLFKEMCPRAYSYAYDEASGLKSCRANRYVITFCPPN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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