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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005661`

染色体: Chr01 坐标: 72947328-72949283 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005661`
名称	SmilChr01G005661
描述	putative F-box protein At3g10430
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	72947328 - 72949283 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005943`
GeneID	`131005943`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005943`
原始查询	`SmilChr01G005661`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box protein At3g10430
产物	putative F-box protein At3g10430
Arabidopsis	`AT1G32600` (AT1G32600) F-box associated ubiquitination effector family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840155] identity=29.1; qcov=0.455; evalue=1.75e-09; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005943

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789050.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057789050.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789050.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789050.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789050.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:72948058`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B122,C3
`Chr1:72948063`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B132,B31
`Chr1:72948064`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A11,C70
`Chr1:72948064`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A11,C70
`Chr1:72948074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,C70
`Chr1:72948086`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A5,B121,C70,C81
`Chr1:72948086`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A5,B121,C70,C81
`Chr1:72948089`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A5,B121,C70,C81
`Chr1:72948089`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	A5,B121,C70,C81
`Chr1:72948128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B132,B31,C65
`Chr1:72948136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B20,B42,B58,C18
`Chr1:72948140`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	37	A2,A20,B103,B109,B125,B132,B135,B138,B14,B16,B20,B26,B42,B43,B53,B56,B58,B66,B78,B85,B90,B92,B94,B95,B96,C1,C18,C40,C52,C55,C71,C82,D11,D2,D4,D5,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789050.1

347 aa

174

347

FBA_3

FBA_1

PF08268 FBA_3 43-246 aa PF07734 FBA_1 50-255 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789050.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	43	246	4.7e-11	43.0	F-box associated beta propeller domain
`XP_057789050.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	50	255	8.8e-19	68.4	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933067.1
TTATTTATTTTAATTCCAGTTCGTTTTATTTTATTTAAATTGTTTTCCTCGGAGAAAGAAGAATAATTTGGAAGCTTTCCTTATTTAAATCCAATAATTCTTAGTTTATTTCCTAATCTCTCATAATTTTATATGCTTGATCCACAAGTTTCACATTTTAGAATCATTATATAACTCCTCTCTTTTGCTCCGATTCTGAACGGCCGCCGTAACTCCTCTCTTCTTATACAACTCCAACCTTCAATACATCTTTACCGATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005943
ATGGAGATGGAGGAGTGCCAAGTTTCTGTGACGCGATTTAGTGGCACTCCGAATGGCAGTCAATATTTAAAGGCTATTAGGCTGAATGGTGACGAGGTCTATGATTTCTTTATTGACATGTCATTTATGGGCGAATTAGAATATGAAAATTACATTCAGACTAGTTATTGTGATGGGATTTTCTGTTTTAAGGATTTTAATGGTCGGATTGCTCTTTGCGACCCGAGGGCCAACACCGTGAAACTCCTTCCCCCGATCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789050.1
MEMEECQVSVTRFSGTPNGSQYLKAIRLNGDEVYDFFIDMSFMGELEYENYIQTSYCDGIFCFKDFNGRIALCDPRANTVKLLPPILPAPPSSQIVVYNCGFGYDFSSDDYKVIRIYDVVKYDIKDFDRYLGATEKCEVFSFKSKSWKEIEYEGCSFICNHGGYALVGCSYHWLAIDFILAFDFSEEKFSHIPLPLSFKEKSFNGNTPACHVVVTPNSRLGVIFYSKVGVSKTFQVWEYGINAEWSQLYNDARLDNVHRP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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