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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005682`

染色体: Chr01 坐标: 73086236-73087103 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005682`
名称	SmilChr01G005682
描述	protein LEAD-SENSITIVE 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	73086236 - 73087103 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005996`
GeneID	`131005996`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005996`
原始查询	`SmilChr01G005682`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LEAD-SENSITIVE 1-like
产物	protein LEAD-SENSITIVE 1-like
Arabidopsis	`AT5G16330` (AT5G16330) NC domain-containing protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831494] identity=46.2; qcov=0.974; evalue=3.04e-46; confidence=medium
Rice	`Os05g0440100` - identity=43.2; qcov=0.968; evalue=4.13e-41; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04970 (LRAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005996

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057789131.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057789131.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057789131.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057789131.1`
5	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057789131.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:73086428`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	79	A14,A2,A23,A24,A5,A9,B101,B102,B104,B105,B111,B112,B118,B120,B124,B138,B139,B14,B140,B15,B18,B19,B27,B28,B29,B3,B32,B33,B42,B43,B47,B48,B49,B52,B53,B54,B57,B60,B61,B64,B71,B72,B82,B83,B85,B86,B87,B89,B92,B95,B98,B99,C16,C20,C25,C31,C32,C36,C42,C45,C46,C54,C55,C57,C58,C60,C61,C63,C68,C72,C73,C78,C82,C84,D1,D10,D5,D6,D9
`Chr1:73086433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C82
`Chr1:73086434`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	143	A10,A11,A13,A14,A16,A19,A20,A21,A22,A23,A5,A7,A9,B100,B102,B104,B107,B108,B110,B118,B119,B12,B121,B125,B127,B13,B131,B135,B137,B14,B15,B16,B2,B20,B22,B23,B24,B26,B28,B29,B30,B32,B33,B34,B35,B37,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B49,B5,B50,B51,B55,B56,B57,B58,B6,B62,B63,B64,B65,B67,B7,B70,B71,B73,B76,B77,B79,B80,B81,B82,B83,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B94,B96,B98,C1,C11,C13,C14,C15,C20,C21,C23,C26,C27,C29,C3,C33,C35,C36,C37,C38,C4,C40,C45,C49,C5,C50,C51,C52,C56,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C65,C67,C69,C70,C71,C72,C74,C76,C78,C8,C81,C83,C84,C85,C87,C9,D1,D11,D3,D8
`Chr1:73086436`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	169	A1,A10,A11,A14,A15,A16,A18,A2,A20,A23,A24,A4,A5,A6,A8,A9,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B108,B109,B110,B111,B112,B113,B118,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B127,B13,B130,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B18,B19,B22,B24,B25,B27,B28,B29,B3,B32,B33,B35,B36,B37,B39,B4,B41,B42,B43,B44,B47,B48,B49,B5,B51,B52,B53,B54,B56,B57,B58,B59,B60,B61,B62,B64,B69,B70,B71,B72,B74,B75,B8,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B90,B91,B92,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C11,C12,C14,C15,C16,C17,C20,C21,C25,C26,C28,C31,C32,C34,C36,C37,C38,C41,C42,C45,C46,C47,C51,C53,C54,C55,C57,C58,C59,C60,C61,C63,C64,C66,C67,C68,C69,C70,C71,C73,C75,C77,C78,C79,C80,C82,C83,C84,C86,C87,C9,D1,D10,D3,D4,D5,D6,D9
`Chr1:73086447`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B140,B70,C82
`Chr1:73086447`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B140,B70,C82
`Chr1:73086460`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	26	A1,A18,A20,A6,B102,B118,B134,B18,B21,B28,B32,B37,B51,B60,B72,B86,C1,C14,C26,C28,C38,C47,C79,C84,C9,D3
`Chr1:73086463`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	133	A10,A11,A14,A15,A16,A18,A2,A20,A21,A24,A4,A5,A6,A9,B100,B101,B103,B105,B106,B108,B109,B110,B113,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B127,B13,B130,B132,B136,B137,B138,B139,B140,B15,B22,B24,B25,B27,B29,B3,B30,B31,B33,B35,B36,B37,B39,B4,B42,B43,B44,B45,B49,B5,B50,B51,B53,B55,B56,B58,B59,B61,B62,B63,B64,B69,B74,B8,B83,B84,B85,B87,B88,B89,B90,B91,B92,B95,B96,B97,B98,C12,C13,C14,C15,C16,C20,C21,C23,C27,C28,C31,C32,C33,C34,C36,C37,C40,C41,C42,C46,C49,C50,C51,C53,C54,C55,C57,C63,C64,C66,C67,C68,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C77,C80,C81,C84,C86,D9
`Chr1:73086492`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B53,C42
`Chr1:73086492`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B53,C42
`Chr1:73086496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B140,C82
`Chr1:73086496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789131.1

189 aa

189

LRAT

PF04970 LRAT 13-153 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789131.1`	Pfam	`PF04970`	LRAT	Domain	13	153	1.1e-22	81.3	Lecithin retinol acyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933148.1
AAAAAAAAATTTCAGAGAGAGCTTAGAGCAATGGGTTTAATCTCAAACAAGGTGCCGAGGCGCTTCCTCAAGCCTGGTGATCACATCTACAGCTGGAGGTTTGGTTTGGTCTACTCCCATCACGGGGTGTTCAGGGGCGAGGGGCAGGTGATACACTTCACGAGCGCGTCATCGTCTTCGGCGGGCCCACGGCGGAGGGGGAGCTGCTCGGCCTGCGAGCTTTTGGAACACAGCGACCGTCACAGCGGGGTGACGGTATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005996
ATGGGTTTAATCTCAAACAAGGTGCCGAGGCGCTTCCTCAAGCCTGGTGATCACATCTACAGCTGGAGGTTTGGTTTGGTCTACTCCCATCACGGGGTGTTCAGGGGCGAGGGGCAGGTGATACACTTCACGAGCGCGTCATCGTCTTCGGCGGGCCCACGGCGGAGGGGGAGCTGCTCGGCCTGCGAGCTTTTGGAACACAGCGACCGTCACAGCGGGGTGACGGTATCATGCCTCGACTGCTTCCTCAGGTCCGGGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789131.1
MGLISNKVPRRFLKPGDHIYSWRFGLVYSHHGVFRGEGQVIHFTSASSSSAGPRRRGSCSACELLEHSDRHSGVTVSCLDCFLRSGWLCRYEYGVSNAAHALRRRGTCNTAESGPVEVVLERAEALLAQNSFGEYHLLENNCEDFATFCKTGQRCNRNGTSRRYGQASVFTLPSRRRRSTKIAARDEGK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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