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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005683`

染色体: Chr01 坐标: 73096556-73096993 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005683`
名称	SmilChr01G005683
描述	protein LEAD-SENSITIVE 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	73096556 - 73096993 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012860`
GeneID	`131012860`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012860`
原始查询	`SmilChr01G005683`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LEAD-SENSITIVE 1-like
产物	protein LEAD-SENSITIVE 1-like
Arabidopsis	`AT4G00905` (AT4G00905) NC domain-containing protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827986] identity=49.6; qcov=0.807; evalue=7.28e-30; confidence=medium
Rice	`Os08g0546900` - identity=40.5; qcov=1.02; evalue=3.5e-27; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04970 (LRAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012860

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057796836.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057796836.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057796836.1`
4	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057796836.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796836.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:73096623`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	40	A20,A23,A24,B102,B105,B118,B123,B124,B138,B140,B15,B18,B30,B32,B47,B48,B54,B57,B60,B64,B71,B86,B89,C1,C28,C32,C36,C38,C46,C53,C61,C62,C63,C68,C73,C82,C84,C9,D5,D6
`Chr1:73096670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B65,B91,C4,D11
`Chr1:73096702`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	29	A20,A23,B102,B105,B123,B138,B18,B30,B32,B37,B47,B48,B54,B57,B64,B85,B86,B89,C1,C16,C26,C28,C32,C38,C46,C53,C68,C73,C9
`Chr1:73096718`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	33	A2,A6,B1,B101,B11,B117,B138,B15,B19,B26,B42,B46,B6,B66,B67,B78,B82,B83,C18,C2,C4,C46,C51,C56,C59,C61,C64,C65,C71,C80,C85,D2,D6
`Chr1:73096722`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	31	A2,A6,B1,B101,B11,B117,B15,B19,B26,B42,B46,B6,B66,B67,B78,B82,B83,C18,C4,C46,C51,C56,C59,C61,C64,C65,C71,C80,C85,D2,D6
`Chr1:73096745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr1:73096768`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr1:73096775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B91,C4,C7,D11
`Chr1:73096781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B40,B91,C7,C80
`Chr1:73096788`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr1:73096803`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	A15,B107,B132,B2,B32,B40,B61,C80,D8
`Chr1:73096805`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A15,B107,B132,B2,B32,B40,B61,C80,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796836.1

145 aa

145

LRAT

PF04970 LRAT 2-115 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796836.1`	Pfam	`PF04970`	LRAT	Domain	2	115	5.3e-17	62.9	Lecithin retinol acyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940853.1
ATGGGTGAAGACCAAGTGGTACACTTCACCTGCGCGTCAGCATCAAGAAGGGGACGAAGCTGCGCAGCTTGTGAGATGTTCGAGTATAGTGATCGCGACAGTGGAGTGATCGCATCTTGTCTCGATTGCTTCCTTAAATCCGGATCGCTGCGCCGTTACAAGTACGGCGTTAGCGAGAGGAGGTACTGGCTGAGACGCCGAGGGACTTGCAACACCGCGGAATCCGGCCCGGTGGAGGTGGTGATGGAGAGGGCTGAGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012860
ATGGGTGAAGACCAAGTGGTACACTTCACCTGCGCGTCAGCATCAAGAAGGGGACGAAGCTGCGCAGCTTGTGAGATGTTCGAGTATAGTGATCGCGACAGTGGAGTGATCGCATCTTGTCTCGATTGCTTCCTTAAATCCGGATCGCTGCGCCGTTACAAGTACGGCGTTAGCGAGAGGAGGTACTGGCTGAGACGCCGAGGGACTTGCAACACCGCGGAATCCGGCCCGGTGGAGGTGGTGATGGAGAGGGCTGAGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796836.1
MGEDQVVHFTCASASRRGRSCAACEMFEYSDRDSGVIASCLDCFLKSGSLRRYKYGVSERRYWLRRRGTCNTAESGPVEVVMERAESLLAKNGFGDYDLLKNNCEDFATFCKTGQGCNRNGTARRYGQASLIPPALASSRRNPKP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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