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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005685`

染色体: Chr01 坐标: 73109795-73113238 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005685`
名称	SmilChr01G005685
描述	uncharacterized SmilChr01G005685
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	73109795 - 73113238 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005925`
GeneID	`131005925`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005925`
原始查询	`SmilChr01G005685`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os10g0520700; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os10g0520700; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G63830` (AT5G63830) HIT-type Zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836503] identity=56.1; qcov=0.968; evalue=3.47e-149; confidence=high
Rice	`Os10g0520700` - identity=59.5; qcov=0.893; evalue=5.09e-164; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04438 (zf-HIT); PF04925 (SHQ1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005925

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789029.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057789029.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057789029.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057789029.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789029.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:73110359`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,B98
`Chr1:73110364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,B64
`Chr1:73110448`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr1:73110532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr1:73110597`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,C18,C57
`Chr1:73110683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:73110861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B121,B41,C3
`Chr1:73110875`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,D9
`Chr1:73110907`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr1:73110947`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr1:73110958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr1:73111876`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789029.1

412 aa

206

412

zf-HIT

SHQ1

PF04438 zf-HIT 23-52 aa PF04925 SHQ1 216-327 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789029.1`	Pfam	`PF04438`	zf-HIT	Domain	23	52	4.4e-11	43.0	HIT zinc finger
`XP_057789029.1`	Pfam	`PF04925`	SHQ1	Domain	216	327	2.1e-08	34.6	SHQ1 protein, Shq1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933046.1
GGCCTTCCATTAAAAAAAATCAATCAAACATTCGCTGTTGTTTTCATCTTCTCTCCGACGCCTCGCCGCCGTTCGCTTGCTGCCGGCGCCGCCTCCGCCCTCCGGTCTTCACGCTAATATAGATATAGATTAATTCAAAACTCCGGCGTATTTCTCCGGCCGTCGTCGTATCTTCCGCCGTAGCGTCGGGCTCGGGAATCGTTGTAACTGAAAACTAAACGGAGAATTCGCATCATTTTGCAGGAGTCTGATATGTCGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005925
ATGTCGTCGGACGCTGTGATAAACTCAGAGGCATCTTCTGGAACTTCGAATTTCAACTCCAACTCACGCATAATCTGCCGCGTATGTGAAAAGCAATTTTCCCAGTATACATGTCCTCGATGCAACATTCGTTATTGTTCTCTGCCTTGTTACAAGTCTCATAGTCTACGTTGTACTGAGTCTTTTATGAGAGAGAATGTAATGGGAGGACTGCAACAAATGCAACCTGATGAGGAAAGTAAAGCTAAAATGCTGGATAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789029.1
MSSDAVINSEASSGTSNFNSNSRIICRVCEKQFSQYTCPRCNIRYCSLPCYKSHSLRCTESFMRENVMGGLQQMQPDEESKAKMLDILKRLHEEEETDGFQEDELNSSLSEETIQKIISGGTISLNDLSLEERKRFERAIASGELSKLIEPWDPWWSRPSAQYISLSSNGTQLVQPFVKEESREHDNDASTDELEEFPPGPETPLPPVSKLTASEPSPLLAIHLVDIIYSYCFTLRLYNGDWKADPLESATVVLSVSSVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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