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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005688`

染色体: Chr01 坐标: 73168441-73170681 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005688`
名称	SmilChr01G005688
描述	uncharacterized SmilChr01G005688
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	73168441 - 73170681 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005974`
GeneID	`131005974`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005974`
原始查询	`SmilChr01G005688`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	FtsJ-like methyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831229]; symbol=AT5G13830; hit=AT5G13830; species=arabidopsis; confidence=high
产物	FtsJ-like methyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831229]; symbol=AT5G13830; hit=AT5G13830; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G13830` (AT5G13830) FtsJ-like methyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831229] identity=70.2; qcov=1; evalue=1.29e-111; confidence=high
Rice	`Os03g0822300` - identity=65.2; qcov=1; evalue=2.26e-97; confidence=high
GO	GO:0001510 (RNA methylation); GO:0008650 (rRNA (uridine-2'-O-ribose)-methyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01728 (FtsJ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005974

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057789096.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057789096.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789096.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789096.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789096.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:73168607`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B37,B53,C76,C87
`Chr1:73168612`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B70,C71
`Chr1:73168621`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B70,C71
`Chr1:73168681`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:73168812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr1:73168861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B127,B5,B83,C28
`Chr1:73168866`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,D11
`Chr1:73168867`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B127,B5,C28,C83
`Chr1:73168870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr1:73168918`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr1:73168919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C38,C52,C53
`Chr1:73168922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B78,C22,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789096.1

230 aa

115

230

FtsJ

PF01728 FtsJ 17-228 aa

XP_057789098.1

227 aa

114

227

FtsJ

PF01728 FtsJ 17-225 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789096.1`	Pfam	`PF01728`	FtsJ	Family	17	228	8.1e-40	137.4	FtsJ-like methyltransferase
`XP_057789098.1`	Pfam	`PF01728`	FtsJ	Family	17	225	3.7e-35	122.2	FtsJ-like methyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933115.1
ACGTTTAGCTGGTCGAACGGCGTCGTTTCGGTATTGCTTAAACCCTGAGAAAAACCCCTCTTTCACTTCCATTTTTCGAAAAAACTGTGACAAAGAAATGAGCGGAGCTCCTGATTTCTTCTACAGAGAAGCTCAGCGCCTTGGTTATGTTGCTCGCTCTGCTTTCAAGATGCAGAAGCAGTACAAGATCATAAGCCCCGGCGGTTCTGTTCTCGATCTAGGCTGTGCTCCCGGTGCTTGGCTTCAGGTGGCATGTCAGA...

XM_057933113.1
AGCTGGTCGAACGGCGTCGTTTCGGTATTGCTTAAACCCTGAGAAAAACCCCTCTTTCACTTCCATTTTTCGAAAAAACTGTGACAAAGAAATGAGCGGAGCTCCTGATTTCTTCTACAGAGAAGCTCAGCGCCTTGGTTATGTTGCTCGCTCTGCTTTCAAGTTGATTCAGATGCAGAAGCAGTACAAGATCATAAGCCCCGGCGGTTCTGTTCTCGATCTAGGCTGTGCTCCCGGTGCTTGGCTTCAGGTGGCATGTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005974
ATGAGCGGAGCTCCTGATTTCTTCTACAGAGAAGCTCAGCGCCTTGGTTATGTTGCTCGCTCTGCTTTCAAGATGCAGAAGCAGTACAAGATCATAAGCCCCGGCGGTTCTGTTCTCGATCTAGGCTGTGCTCCCGGTGCTTGGCTTCAGGTGGCATGTCAGAATTTAGGTCCATTGGAGAAGGGCGGAACAGTTGTGGGGATTGATACTAAGAAGGTGAAGGTGCCGCCCCTCCACTGCGATTCGAGGGTTAAAACTGT...

LOC131005974
ATGAGCGGAGCTCCTGATTTCTTCTACAGAGAAGCTCAGCGCCTTGGTTATGTTGCTCGCTCTGCTTTCAAGTTGATTCAGATGCAGAAGCAGTACAAGATCATAAGCCCCGGCGGTTCTGTTCTCGATCTAGGCTGTGCTCCCGGTGCTTGGCTTCAGGTGGCATGTCAGAATTTAGGTCCATTGGAGAAGGGCGGAACAGTTGTGGGGATTGATACTAAGAAGGTGAAGGTGCCGCCCCTCCACTGCGATTCGAGGGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057789096.1
MSGAPDFFYREAQRLGYVARSAFKLIQMQKQYKIISPGGSVLDLGCAPGAWLQVACQNLGPLEKGGTVVGIDTKKVKVPPLHCDSRVKTVCGDVMKLPREKVRALSPKQKGFSVILSDMCPLVSGITTRDAALSAELGMRALDLAVGKAAVDHTLHDAPQEVQSDSSGSAPDTGRLLKPGGHLIIKLLESEDVKEFNQICKPLFRKASWLRPKATRSCSREIYLICQGLL

XP_057789098.1
MSGAPDFFYREAQRLGYVARSAFKMQKQYKIISPGGSVLDLGCAPGAWLQVACQNLGPLEKGGTVVGIDTKKVKVPPLHCDSRVKTVCGDVMKLPREKVRALSPKQKGFSVILSDMCPLVSGITTRDAALSAELGMRALDLAVGKAAVDHTLHDAPQEVQSDSSGSAPDTGRLLKPGGHLIIKLLESEDVKEFNQICKPLFRKASWLRPKATRSCSREIYLICQGLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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