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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005698`

染色体: Chr01 坐标: 73244424-73246790 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005698`
名称	SmilChr01G005698
描述	protein LEAD-SENSITIVE 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	73244424 - 73246790 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005993`
GeneID	`131005993`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005993`
原始查询	`SmilChr01G005698`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LEAD-SENSITIVE 1-like
产物	protein LEAD-SENSITIVE 1-like
Arabidopsis	`AT5G06370` (AT5G06370) NC domain-containing protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830525] identity=45.2; qcov=0.907; evalue=1.93e-41; confidence=medium
Rice	`Os09g0526800` (OJ1439_F07.19-1) - identity=48.1; qcov=0.79; evalue=1.61e-44; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04970 (LRAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005993

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057789128.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057789128.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789128.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789128.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789128.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:73244568`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	24	A25,A6,B105,B106,B121,B125,B127,B17,B19,B54,B59,B65,B76,B84,B89,B90,B92,C24,C5,C53,C58,C8,C82,D7
`Chr1:73244577`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A3,B80,C25,C64,C66,D4
`Chr1:73244591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B11,B113
`Chr1:73244597`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	A25,B122,B25,B46,B72,B78,B8,B82,C16,C2,C39,C67,C75,D8
`Chr1:73244599`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr1:73244604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B13,C17,C5
`Chr1:73244614`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr1:73246103`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B46
`Chr1:73246103`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B46
`Chr1:73246105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B35,B42,B43,C15,C64
`Chr1:73246140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,B88,C62
`Chr1:73246185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789128.1

205 aa

102

205

LRAT

PF04970 LRAT 14-154 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789128.1`	Pfam	`PF04970`	LRAT	Domain	14	154	4e-26	92.4	Lecithin retinol acyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933145.1
CACCAATTTGGAATAAGAGTGATCAAAGAGGAGTATATAATACTCGTCTTCTTCTTTAAATGTTTCCAATTATAAACATTTTTTAAAATTGAATTCATCAATTGATACAGCAGACTCAGTGAGTGAGAGATGGGGTTTTTGTCACGTAAAGTAGCGAGATACTACTTGAATGCAGGCGATCATATTTACACCTGGAGAACTGGCTTTGTTTACGCGCACCATGGTATCTACAAGGACGACGGGCAAGTGGTGCACTTCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005993
ATGGGGTTTTTGTCACGTAAAGTAGCGAGATACTACTTGAATGCAGGCGATCATATTTACACCTGGAGAACTGGCTTTGTTTACGCGCACCATGGTATCTACAAGGACGACGGGCAAGTGGTGCACTTCACCTGCCCAAAATCAGCATCTTCGGCTCCACTAAAAAGAAGAAGGGAAAGTTGCTCAACTTGTGAGAAGTTTGAGCATAGCGATCGTGACAGTGGTGTCATCATATCTTGTCTCGATTGCTTCCTTAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789128.1
MGFLSRKVARYYLNAGDHIYTWRTGFVYAHHGIYKDDGQVVHFTCPKSASSAPLKRRRESCSTCEKFEHSDRDSGVIISCLDCFLKKGKLYRHKYGVKKTTHRLSRRGTCNTAKSDPAEVVMARVELKLANGFGEYDLLDNNCEDFATYCKTGQKCKRTGQASIIPQEWRSHELILGGAKLVRGLKGGNPHFFGKGISYIIDIFT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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