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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005702`

染色体: Chr01 坐标: 73262006-73265482 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005702`
名称	SmilChr01G005702
描述	receptor-like cytoplasmic kinase 176
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	73262006 - 73265482 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005934`
GeneID	`131005934`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005934`
原始查询	`SmilChr01G005702`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like cytoplasmic kinase 176
产物	receptor-like cytoplasmic kinase 176
Arabidopsis	`AT5G02290` (NAK) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831880] identity=62.7; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0110900` (OsRLCK176) - identity=65; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005934

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057789037.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789037.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789037.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789037.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789037.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:73262557`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,D11
`Chr1:73262619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B140,C52,C60
`Chr1:73262710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B105,C13,C17
`Chr1:73262725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B2
`Chr1:73262775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr1:73262781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr1:73262830`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B51
`Chr1:73262830`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B51
`Chr1:73262832`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr1:73262863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B112,B75
`Chr1:73262884`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr1:73263149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C40,C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789037.1

392 aa

196

392

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 75-352 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 76-354 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789037.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	75	352	3.8e-45	155.0	Protein kinase domain
`XP_057789037.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	76	354	1.4e-46	159.7	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933054.1
CTGGTTGCCTATAGGAGCCAACCTTCTCGTGACTCCCAACTCCAACCCACGTAATAAAACACACACACACACACACATTAAATACGCTTTCACCACACATTTCTCTTTTCCTTCGTTCACACCTCCTGCTTGAATTTTCCAGCTGTGGGTTTTCGCTCTAGATTGAATTGCATCCTTATCTCCTTTCACACCTCTGAATCTTGCTCTTTGAGGGGAGAGAATTGATGGGTTCTTGCTGCAGCGCCCGAATACGGGCGCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005934
ATGGGTTCTTGCTGCAGCGCCCGAATACGGGCGCACCATAGCCCTCAGAGAGATGGGCCAAGTTCTAGGCATGTTAGCTTTGATGGGGGGGAGACGAGCAGCAGGCGCTCGTCTCCCTCGTTGCCATTGACCCCTCGGAATGAGGGTGAAATCTTGGACACCGGGGGTTTGAAGAGCTTCGGATTCAATGATCTCAGGATATGTACTAGAAACTTCCGCCCCGACAGTGTGTTGGGGGAGGGTGGATTTGGCTGCGTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789037.1
MGSCCSARIRAHHSPQRDGPSSRHVSFDGGETSSRRSSPSLPLTPRNEGEILDTGGLKSFGFNDLRICTRNFRPDSVLGEGGFGCVFKGWIDEQTFKAAKAGTGTVIAVKRLNQEGSQGHKEWLTEINYLGQLHHPNLVKLIGYCLEDEHRLLVYEFMPRGSLENHLFRRTSYFQPLDWTLRMKVALGAARGLAFLHSPEAKVIYRDFKASNILLDANYNAKLSDFGLAKDGPLDGRSHVSTRIMGTYGYAAPEYMATGH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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