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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005703`

染色体: Chr01 坐标: 73274296-73277234 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005703`
名称	SmilChr01G005703
描述	DNA replication complex GINS protein PSF2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	73274296 - 73277234 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005991`
GeneID	`131005991`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005991`
原始查询	`SmilChr01G005703`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA replication complex GINS protein PSF2
产物	DNA replication complex GINS protein PSF2
Arabidopsis	`AT3G12530` (PSF2) PSF2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820432] identity=64.2; qcov=1.01; evalue=4.13e-93; confidence=high
Rice	`Os01g0248600` (PSF2) - identity=69.9; qcov=0.933; evalue=3.19e-100; confidence=high
GO	GO:0000727 (double-strand break repair via break-induced replication); GO:0000811 (GINS complex); GO:0005634 (nucleus); GO:0006260 (DNA replication)
KEGG	-
Pfam	PF05916 (Sld5); PF25005 (PSF2_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005991

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789126.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057789126.1`
3	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057789126.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789126.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789126.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:73274413`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr1:73274421`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr1:73274422`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,C5,C82,C85
`Chr1:73275450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:73275780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,D4
`Chr1:73276437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:73276489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr1:73276818`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B133,B29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789126.1

210 aa

105

210

PSF2_N

Sld5

PF25005 PSF2_N 14-71 aa PF05916 Sld5 76-177 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789126.1`	Pfam	`PF25005`	PSF2_N	Domain	14	71	1.4e-28	99.4	PSF2 N-terminal domain
`XP_057789126.1`	Pfam	`PF05916`	Sld5	Domain	76	177	8.3e-15	55.6	GINS complex protein helical bundle domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933143.1
CAAATTTCCCACAAAATTCCCGCCATCACCTGCTTGAGACTTGAGAGTTAGGGCTGGGAGCTCACATCCTACTCACCTCCGCCCAACTCCATACAACCGCCGCAACGGAAAATGGCCGGCGCCTCCGATCCCCATGGCTCCGCGTTTTCGGCCGCAGAGCTGGAGTTTCTTGCGGAGGATGAAATGATTGAAATTGTTCCGAATTTGAGAATGGATCCGCTCAATTTTATATCTGGGGATTTCGGTCCTTTTAGACCCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005991
ATGGCCGGCGCCTCCGATCCCCATGGCTCCGCGTTTTCGGCCGCAGAGCTGGAGTTTCTTGCGGAGGATGAAATGATTGAAATTGTTCCGAATTTGAGAATGGATCCGCTCAATTTTATATCTGGGGATTTCGGTCCTTTTAGACCCCAAATACCAACTCAAGCGCCGCTGTGGCTGGCCGTGGCCTTGAAGAAGAGAGGGAAGTGCACAATTCGAGCTCCAGAGTGGATGTCTGTTGATAAGTTATCACAAGTACTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789126.1
MAGASDPHGSAFSAAELEFLAEDEMIEIVPNLRMDPLNFISGDFGPFRPQIPTQAPLWLAVALKKRGKCTIRAPEWMSVDKLSQVLEAERDSEKFQPLPFHYVEISRLLFDHARDDIPDIYMVRSLIEDIKDVRFHKIGKGLEIISKERTYALRLKNLSAMEANIVRPFVTRALETFYKLGSSDMIQESDHAPNRQQATNRGPRRQLKDR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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