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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005704`

染色体: Chr01 坐标: 73280276-73283307 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005704`
名称	SmilChr01G005704
描述	uncharacterized SmilChr01G005704
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	73280276 - 73283307 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005963`
GeneID	`131005963`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005963`
原始查询	`SmilChr01G005704`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cruciferin (DUF506) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818548]; symbol=AT2G39650; hit=AT2G39650; species=arabidopsis; confidence=high
产物	cruciferin (DUF506) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818548]; symbol=AT2G39650; hit=AT2G39650; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G39650` (AT2G39650) cruciferin (DUF506) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818548] identity=57.5; qcov=0.887; evalue=1.24e-100; confidence=high
Rice	`Os01g0973600` - identity=63.7; qcov=0.884; evalue=7.51e-99; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04720 (PDDEXK_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005963

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789077.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057789077.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057789077.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789077.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789077.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:73280886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,D4
`Chr1:73280969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B37,B44,B80,C74
`Chr1:73280997`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr1:73280999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,B18
`Chr1:73281036`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B90,B92
`Chr1:73282093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,C71
`Chr1:73282165`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C26
`Chr1:73282547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr1:73282549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B46,B75,B81,C75
`Chr1:73282603`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B52,B73,C35
`Chr1:73282609`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:73282771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B75,B81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789077.1

302 aa

151

302

PDDEXK_6

PF04720 PDDEXK_6 35-241 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789077.1`	Pfam	`PF04720`	PDDEXK_6	Family	35	241	3.8e-63	214.1	PDDEXK-like family of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933094.1
CCAGTTGCCTTCTTCGTCTTCCTTCTCTTCTCTTTCCACCTAAATCTCTTCTCTCTCTTCTCCCTCTCCTATTTTATTTTATTTTATTGCGATTATTTTCATTCTTATATATATATATGTATGTATCTATAGGATGATTCATTTCTATTCATTATCCGTTTCTGGATTGGGGAGCGGTGTTTCAACAACAAATCCGAGCTCATTAATCTGCTGATTTAGGTTTCGTTTAGGGACACAAATGGTGCAATTGTTTTACAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005963
ATGAACTGCAAGGTTTATAGGTCGTCGTCCGATGAGTTGTGGGCGAGGCAGTCGAATGGAGGAGGTGGAGTGAGCCATGAGAGCGAGCATGATTTGGCGCTCATGGTTAATGATTTCCTCGAGAATGGGAATAGTTGTGGCGCTGATTCTCGGTACAGCAGCGACAGCGACTCCAGCCTCTCTGATCTCCTTCAGCTCGCTGACAAAATCTCCTATTTCAAGTTGGTGATGGATCAATATGAAAACGACTTGCTGTCGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789077.1
MNCKVYRSSSDELWARQSNGGGGVSHESEHDLALMVNDFLENGNSCGADSRYSSDSDSSLSDLLQLADKISYFKLVMDQYENDLLSVVNSLALSINERDLHAASSGPCKASCIRFSLVKLLRMSGYDAGLCTSRWQGSDKVPGGDHEYIDVIRYNDTGVTERVIVDIDFRSQFEIARAVDSYDRILNSLPVIYVGSFTKLKQFLQVMVEAARSSLKQNSMPLPPWRSLAYLQAKWQSPHQRKFDSSEHNSSTTAPVDHKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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