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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005716`

染色体: Chr01 坐标: 73366218-73368088 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005716`
名称	SmilChr01G005716
描述	CASP-like protein PIMP1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	73366218 - 73368088 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006006`
GeneID	`131006006`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006006`
原始查询	`SmilChr01G005716`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CASP-like protein PIMP1
产物	CASP-like protein PIMP1
Arabidopsis	`AT2G39530` (AT2G39530) Uncharacterized protein family (UPF0497) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818538] identity=44.6; qcov=0.914; evalue=3.25e-28; confidence=medium
Rice	`Os05g0344400` - identity=29.4; qcov=0.901; evalue=2.16e-12; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04535 (CASP_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006006

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057789141.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789141.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789141.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789141.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789141.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:73366384`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	A13,B100,B105,B129,C30,C8,D11
`Chr1:73366394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B18,C37,C8
`Chr1:73366395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,C83
`Chr1:73366399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr1:73366512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr1:73366531`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B71,B80,C22,C83
`Chr1:73366982`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B109,B121,B29,B37,B4,B72,B78,B8,C82
`Chr1:73366989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,A7,B137,C43
`Chr1:73367045`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A4,B67
`Chr1:73367045`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	A4,B67
`Chr1:73367046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B24,B67
`Chr1:73367053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789141.1

162 aa

162

CASP_dom

PF04535 CASP_dom 13-146 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789141.1`	Pfam	`PF04535`	CASP_dom	Domain	13	146	2.7e-22	79.9	Casparian strip membrane protein domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933158.1
ATCGTGGCAAATACTAACTAAATAAACTCTATAAATAGATATCATCTCTTAGTACTACTCTACACCTAAATCTTTTGGTATATATTCTAAGTTTGTGTGATCCTTACCACAAACACACACACACACACATACACATATTTGATCCGTCGTCGACGAGATGGCTCCACCACCATCGACGACAGTCTCACCGGCTACAACATTGATCGTACGAGTGGTTACTCTTGTTTGCTTGCTCATATCTGTTATCGTTATTGCCACCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006006
ATGGCTCCACCACCATCGACGACAGTCTCACCGGCTACAACATTGATCGTACGAGTGGTTACTCTTGTTTGCTTGCTCATATCTGTTATCGTTATTGCCACCAATAATCCTGAAGTAGATGGAGGCAAGATGAAGTTCAACGATTTCTACGCTTATCGCTACATGTTGGCAACAGGGGTTGTTGGAATTGCTTATACATTCCTTCAAATTGCATTCACAATTTACTTTGTGAGCACTGGAAATAGGCTAGGTGGCAATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789141.1
MAPPPSTTVSPATTLIVRVVTLVCLLISVIVIATNNPEVDGGKMKFNDFYAYRYMLATGVVGIAYTFLQIAFTIYFVSTGNRLGGNGLMFLDFFGDKALSYLLATGAAAGFGLTVDLNRIGFESDVKDFLNKANAAASLLFFGFIFSVVSSIFSSFSLPKSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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