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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005722`

染色体: Chr01 坐标: 73389969-73392825 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005722`
名称	SmilChr01G005722
描述	ENTH domain-containing protein C794.11c-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	73389969 - 73392825 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005978`
GeneID	`131005978`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005978`
原始查询	`SmilChr01G005722`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ENTH domain-containing protein C794.11c-like
产物	ENTH domain-containing protein C794.11c-like
Arabidopsis	`AT3G46540` (AT3G46540) ENTH/VHS family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823807] identity=55.9; qcov=0.644; evalue=1.93e-62; confidence=high
Rice	`Os01g0841000` (P0408C03.31-1) - identity=56.8; qcov=0.64; evalue=1.05e-58; confidence=high
GO	GO:0005543 (phospholipid binding); GO:0005768 (endosome); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006897 (endocytosis); GO:0030125 (clathrin vesicle coat); GO:0030276 (clathrin binding)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01417 (ENTH); PF07651 (ANTH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005978

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057789102.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057789102.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789102.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789102.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789102.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:73390209`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B25,B45,B61,C72
`Chr1:73390252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:73390286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,C15
`Chr1:73390316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:73390330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr1:73390381`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B106,B138,C85
`Chr1:73390438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr1:73390443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr1:73391466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B98,C48
`Chr1:73392365`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,C1,C51,C73
`Chr1:73392540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B36
`Chr1:73392603`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789102.1

264 aa

132

264

ENTH

ANTH

PF01417 ENTH 31-154 aa PF07651 ANTH 41-125 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789102.1`	Pfam	`PF01417`	ENTH	Repeat	31	154	9e-29	100.7	ENTH domain
`XP_057789102.1`	Pfam	`PF07651`	ANTH	Repeat	41	125	2.2e-05	24.3	ANTH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933119.1
TTTTGAAGTCATCTTATCTTCTCCAATACACATGCAAATCCACTTTATAGAGTGGTTGAATTCTCATTGTGCTATAATGGAGTGGTTATATTGCCTACCTCATCTAGACTATTTTTCCTCACATTTCTATGATTTTTTTGTGTGTGTAAATATGGATACACTCATATATATAAATAGCCCATTAATGCAAAAACATTGAAAACCACAAACATTTGACAAAAATGGGGTCTTTGATGGAAGATTTCAAGAGACAAGCTTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005978
ATGGGGTCTTTGATGGAAGATTTCAAGAGACAAGCTTCATTTTTCTTGAGAGAGAAGATCAAGAGAGCAAGATTGGTTCTAACTGATGTGACACCTGCACAATTATTGACAGAAGATGTGACAAATGGAGATTCATTGGCAGCAGATGTTCATGCCATGAGACTCATAGCTCGTGCTGCCTTCGAAGTTGATGATTATGAACGAATTGTTCATATCTTGCACCACAGGTTGTCGAAGTTCGAAACATGGAATTGGAGGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789102.1
MGSLMEDFKRQASFFLREKIKRARLVLTDVTPAQLLTEDVTNGDSLAADVHAMRLIARAAFEVDDYERIVHILHHRLSKFETWNWRASYKALILLEHLLTHGPQRIAEEFESDEDTIRDMATFHFIDDKGFNWGLSVKNKSERVVDLLQDRSYLKEERARARKLTVGIKGFGSFNHTQSSGNDDGDNDHHPVFRSKSLFLGGHRHRDAAAKANLLGSDEYTKLLATNMMAENDSNIKGCSHPIEEDHPFWDKEHQTRVSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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